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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001968`

染色体: Chr05 坐标: 20276669-20279892 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001968`
名称	SmilChr05G001968
描述	uncharacterized TPR repeat-containing protein At1g05150-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20276669 - 20279892 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986622`
GeneID	`130986622`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986622`
原始查询	`SmilChr05G001968`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Calcium-binding tetratricopeptide family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839312]; symbol=AT1G05150; hit=AT1G05150; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Calcium-binding tetratricopeptide family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839312]; symbol=AT1G05150; hit=AT1G05150; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G05150` (AT1G05150) Calcium-binding tetratricopeptide family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839312] identity=75.8; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0263900` - identity=64.4; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00515 (TPR_1); PF07719 (TPR_2); PF13174 (TPR_6); PF13176 (TPR_7); PF13181 (TPR_8); PF13374 (TPR_10); PF13414 (TPR_11); PF13424 (TPR_12); PF13432 (TPR_16); PF14559 (TPR_19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986622

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057766062.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057766062.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057766062.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057766062.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766062.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20277205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr5:20277207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:20277333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:20277522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,C61,C85
`Chr5:20277673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B44,B70,C28,C58
`Chr5:20277687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:20277931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr5:20278476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:20278812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:20279085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766062.1

805 aa

402

805

TPR_8

TPR_16

TPR_11

TPR_8

TPR_11

TPR_19

TPR_10

TPR_6

TPR_1

TPR_2

TPR_8

TPR_7

TPR_12

TPR_16

TPR_19

PF13181 TPR_8 349-376 aa PF13432 TPR_16 350-410 aa PF13414 TPR_11 351-392 aa PF13181 TPR_8 378-410 aa PF13414 TPR_11 387-426 aa PF14559 TPR_19 389-439 aa PF13374 TPR_10 413-442 aa PF13174 TPR_6 413-444 aa PF00515 TPR_1 413-445 aa PF07719 TPR_2 413-445 aa PF13181 TPR_8 413-445 aa PF13176 TPR_7 414-443 aa PF13424 TPR_12 414-476 aa PF13432 TPR_16 416-474 aa PF14559 TPR_19 423-486 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	349	376	7.2e-23	79.5	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	350	410	9.3e-16	58.7	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13414`	TPR_11	Repeat	351	392	9.9e-22	77.1	TPR repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	378	410	7.2e-23	79.5	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13414`	TPR_11	Repeat	387	426	9.9e-22	77.1	TPR repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF14559`	TPR_19	Repeat	389	439	2.4e-17	63.7	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	413	442	7.1e-10	39.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13174`	TPR_6	Repeat	413	444	7.2e-10	39.6	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF00515`	TPR_1	Repeat	413	445	3.3e-26	90.7	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF07719`	TPR_2	Repeat	413	445	1.9e-30	103.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	413	445	7.2e-23	79.5	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13176`	TPR_7	Repeat	414	443	1e-11	44.6	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	414	476	9.9e-16	58.4	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	416	474	9.3e-16	58.7	Tetratricopeptide repeat
`XP_057766062.1`	Pfam	`PF14559`	TPR_19	Repeat	423	486	2.4e-17	63.7	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910079.1
AGTTGAGCCAACAATGACACCCACTAGCCATCATTAACCCCAAAATAGATCAGCCAAGTAAACAAATTAAAAAAACAAAAAGATAAAAATAAAATAAAATAAAATTTAATTTAATTCCTTCAAAAGATAAATTAAATTCCCAGTCTGTCTCCGCCCCCACCAAACCCATTCAATCATCACAGCCACAATTTTCTGGCAAAATTAAGATGAAAAGAAACAATTAAAACAAATGGAAAATGAATTTAGGGAGAAAAACAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986622
ATGACGAGTCGAGGGAGCAGATCGGAGAAAGTGAAGCGAATATTCCAGCAATTCGATGCGAACAGAGATGGGGGCTTGAACCGGGAGGAGATGGCGGCGCTTGTGGTGGCCGTGAACCCTAGGGTTAAGTTCAGCGACGAACAGATTAGCGCAATTCTCGACGAGGTATTCCGCACGTACGGGGAATTCATCGACGGTGAGAAAGGCCTCACCTTTGACGGCCTCCTCCGGACCTACGACGACGGAGCCGGAGACGTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766062.1
MTSRGSRSEKVKRIFQQFDANRDGGLNREEMAALVVAVNPRVKFSDEQISAILDEVFRTYGEFIDGEKGLTFDGLLRTYDDGAGDVDRDFDALGLELKPSEDKNGISQASEEAASSSSVADERVMEPHKKQRTAAWAASPNHGIVFDDTWKLVDDLEILINRLKMKQMKDGKIKNDNSDVFSDPGWSRELGPSSEISDKRVIWDESSADYAAFVKELGVLRSRADRARSRAEAFDGQMAIGRVLYEHYLFKEALVSFKRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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