当前解析结果
SmilChr05G001970| 统一新 Gene ID | SmilChr05G001970 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G001970 |
| 描述 | glutathione S-transferase T3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 20331056 - 20333011 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025630 |
|---|---|
| GeneID | 131025630 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025630 |
| 原始查询 | SmilChr05G001970 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glutathione S-transferase T3-like |
| 产物 | glutathione S-transferase T3-like |
| Arabidopsis | AT5G41220 (GSTT3)glutathione S-transferase THETA 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834124] identity=27.6; qcov=0.582; evalue=1.01e-13; confidence=low |
| Rice | Os11g0303800- identity=24.4; qcov=1; evalue=2.33e-17; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025630 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811409.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811409.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811409.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811409.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057811409.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:20331084 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,B66 |
Chr5:20331100 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B126,B7,C14,C76 |
Chr5:20331101 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B126 |
Chr5:20331121 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C12,D1 |
Chr5:20331146 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B121,C39,C63,C76 |
Chr5:20331147 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B121,B86,C39,C51,C63 |
Chr5:20331149 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B122,B64,C11 |
Chr5:20331195 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B126,C63 |
Chr5:20331205 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C63 |
Chr5:20331215 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,B25 |
Chr5:20331216 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr5:20331223 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B130,C36 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。