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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001972`

染色体: Chr05 坐标: 20349377-20351418 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001972`
名称	SmilChr05G001972
描述	aldehyde oxidase GLOX-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20349377 - 20351418 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986625`
GeneID	`130986625`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986625`
原始查询	`SmilChr05G001972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aldehyde oxidase GLOX-like
产物	aldehyde oxidase GLOX-like
Arabidopsis	`AT1G75620` (AT1G75620) glyoxal oxidase-related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843897] identity=62.8; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0258900` - identity=58.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07250 (Glyoxal_oxid_N); PF09118 (GO-like_E_set)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986625

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057766067.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766067.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766067.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766067.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766067.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20349590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr5:20349623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:20349626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr5:20349779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B28,B31,C31,C45
`Chr5:20349852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr5:20349881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,C32,C68
`Chr5:20349899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C17,C63,C72,C74
`Chr5:20349912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,C13,C63,C9
`Chr5:20349913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C63
`Chr5:20349920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr5:20349926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr5:20349942`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A3,B6,C32,C64,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766067.1

535 aa

268

535

Glyoxal_oxid_N

GO-like_E_set

PF07250 Glyoxal_oxid_N 33-420 aa PF09118 GO-like_E_set 429-534 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766067.1`	Pfam	`PF07250`	Glyoxal_oxid_N	Repeat	33	420	2.6e-181	603.2	Glyoxal oxidase N-terminus
`XP_057766067.1`	Pfam	`PF09118`	GO-like_E_set	Domain	429	534	5.4e-27	94.7	Galactose oxidase-like, Early set domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910084.1
TTATAGTTTTTTAGATTACGATTCACATCTGGCGTTCATTTTGTATCAACCACGCCGACTGCCGTGGGTTAAAGAAATTGGAAAATTAATCCCACGCGCCGGTAGCTTGCGTGTGGTGATCTCTAGAATTGTACAATATAAACCCCATGCCATCACCACCACCTCCGGCCCATCTCCTTCCAATCCAAACATGCCCCCACCACTAATCCTGCTCGTCCTCCTCCTGCTCCCACGCGCCGCCAATGGCGAGTGGGGCCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986625
ATGCCCCCACCACTAATCCTGCTCGTCCTCCTCCTGCTCCCACGCGCCGCCAATGGCGAGTGGGGCCTCCTCCACCCGAACATCGGCGTATCCGCCATGCACATGCAGCTCCTCTTCACCGACCGCGTCCTCATCTTCGACCGCACCGACTTCGGCGCCTCCAACATCTCCCTCCCCGCGGGCAGGTGCCGCCGCGACCCCAACGACACCGCCCTCCCCGTCGACTGCACCGCCCACTCCGTCGAGTACCACCCGGCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766067.1
MPPPLILLVLLLLPRAANGEWGLLHPNIGVSAMHMQLLFTDRVLIFDRTDFGASNISLPAGRCRRDPNDTALPVDCTAHSVEYHPASNSVRPLTVLTDTWCSSAAVLPNGTVLQTGGYNDGDRASRLYKPCAAADASCDWQEINPALALRRWYATNHILPDGRVIIVGGRRQFSYEFYPRRSEAERPRNLPFLVETNDPRVENNLYPFVFLNVDGNLFIFANNRAVLLDYAKGVVVKTYPTIPGGDPRSYPSSGSAVLLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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