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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001977`

染色体: Chr05 坐标: 20435345-20437510 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001977`
名称	SmilChr05G001977
描述	uncharacterized SmilChr05G001977
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20435345 - 20437510 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986632`
GeneID	`130986632`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986632`
原始查询	`SmilChr05G001977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	39S ribosomal protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833956]; symbol=AT5G39600; hit=AT5G39600; species=arabidopsis; confidence=high
产物	39S ribosomal protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833956]; symbol=AT5G39600; hit=AT5G39600; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G39600` (AT5G39600) 39S ribosomal protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833956] identity=80.2; qcov=0.797; evalue=8.98e-73; confidence=high
Rice	`Os02g0282100` - identity=54.5; qcov=0.905; evalue=1.85e-49; confidence=medium
GO	GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10780 (MRP_L53)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986632

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057766075.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057766075.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766075.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766075.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20435447`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A4,B108,B109,B113,B126,B13,B27,B28,B31,B34,B37,B42,B43,B6,B73,B84,B99,C11,C30,C31,C4,C42,C45,C55,C67,C69,C83,D1
`Chr5:20435633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766075.1

158 aa

158

MRP_L53

PF10780 MRP_L53 41-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766075.1`	Pfam	`PF10780`	MRP_L53	Family	41	92	8.4e-15	55.3	39S ribosomal protein L53/MRP-L53

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910092.1
GAATATTAAGTGTAGAAATGAGGAGCAAATGATAATAAAAATTGTGTTGAGCCTTAAACCCTGTGCACACACAACACACACACTAGACGAAGGGAAGGAAGGAGAGAGAAAGAAAATGTTGAAGTTCTTGTCGAAGGTGAGGATCGAATTCAACGCGCTGGACCCTCGATTGGCATCGTGCATGGAGTTCCTGGCGCAGTGCAACGCCCGCAAGGCCAAGGAGTCCAACCCCAGCTGCCAGATCCAAGTCAAGCGCCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986632
ATGATAATAAAAATTGTGTTGAGCCTTAAACCCTGTGCACACACAACACACACACTAGACGAAGGGAAGGAAGGAGAGAGAAAGAAAATGTTGAAGTTCTTGTCGAAGGTGAGGATCGAATTCAACGCGCTGGACCCTCGATTGGCATCGTGCATGGAGTTCCTGGCGCAGTGCAACGCCCGCAAGGCCAAGGAGTCCAACCCCAGCTGCCAGATCCAAGTCAAGCGCCGCACCGACGATTTCCCCCCGCAGATCACCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766075.1
MIIKIVLSLKPCAHTTHTLDEGKEGERKKMLKFLSKVRIEFNALDPRLASCMEFLAQCNARKAKESNPSCQIQVKRRTDDFPPQITVTFVNGVEETFDATSTPAQHIRTLILDKGRVLETEQMFREAGEKWPVLIPDHELHQPFTGIKPKKAEDKPQQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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