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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001981`

染色体: Chr05 坐标: 20505411-20507625 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001981`
名称	SmilChr05G001981
描述	probable diphthine methyl ester synthase
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20505411 - 20507625 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986634`
GeneID	`130986634`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986634`
原始查询	`SmilChr05G001981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable diphthine methyl ester synthase
产物	probable diphthine methyl ester synthase
Arabidopsis	`AT4G31790` (AT4G31790) Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829307] identity=77.6; qcov=1; evalue=5.71e-159; confidence=high
Rice	`Os03g0355800` - identity=71.9; qcov=1.01; evalue=9.84e-155; confidence=high
GO	GO:0004164 (diphthine synthase activity); GO:0017183 (protein histidyl modification to diphthamide)
KEGG	-
Pfam	PF00590 (TP_methylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986634

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766078.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766078.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766078.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766078.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766078.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20505630`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B103,B12,B46
`Chr5:20505630`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B103,B12,B46
`Chr5:20505669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B27
`Chr5:20505723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:20507286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr5:20507292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C82
`Chr5:20507308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766078.1

275 aa

138

275

TP_methylase

PF00590 TP_methylase 1-241 aa

XP_057766079.1

271 aa

136

271

TP_methylase

PF00590 TP_methylase 1-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766078.1`	Pfam	`PF00590`	TP_methylase	Domain	1	241	1.2e-23	84.9	Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases
`XP_057766079.1`	Pfam	`PF00590`	TP_methylase	Domain	1	237	2.4e-23	83.9	Tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) Methylases

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910095.1
ACAGAAGCCCTTTGATTGACAAAAATATAAATCGTCGACAGCAGGGTTCGAACCTGCGCGGGCGAAGCCCAACAGATTTCAAGTCTGTCTCCTTAACCACTCGGACATATCGACTGATTGTGATTAAGATCTTATTATTATTATTATTTAACTATAATTATAATTATAACAAATCCTGGGTTTATCTAGGGTTTATCTAGGGTTCGTATTTGAGAGTTGGGACCTCCCAAAATTACACCAACTCTACACAAAAGAAAATT...

XM_057910096.1
GTATTTGAGAGTTGGGACCTCCCAAAATTACACCAACTCTACACAAAAGAAAATTCCCCAAAAAGGCGAGGATGTTATACATAATTGGATTGGGGTTAGGAGATGAGAAAGACATCACACTAAGAGGGCTCGAGGCAATCAAGAAATGCAGTAAAGTTTATATGGAGGCCTACACTTCTCTCCTCTCCTTCGGCATCACCTCCGATGGCCTCTCCAAATTGGAAAAGGTTTATGGGAGACCTATAATTGTCTCAGACAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986634
ATGTTATACATAATTGGATTGGGGTTAGGAGATGAGAAAGACATCACACTAAGAGGGCTCGAGGCAATCAAGAAATGCAGTAAAGTTTATATGGAGGCCTACACTTCTCTCCTCTCCTTCGGCATCACCTCCGATGGCCTCTCCAAATTGGAAAAGGTTTATGGGAGACCTATAATTGTCTCAGACAGGGAAATGGTTGAGGAGAAGGCAGATGACATGCTGTTAGAAGCTCAGGTTTCTGACGTGGCATTTCTGGTCGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766078.1
MLYIIGLGLGDEKDITLRGLEAIKKCSKVYMEAYTSLLSFGITSDGLSKLEKVYGRPIIVSDREMVEEKADDMLLEAQVSDVAFLVVGDPFGATTHSDLVVRAKKLGVNIKVVHNASVMNAIGVCGLQLYRYGETISIPFFTETWKPDSFYDKIKRNRELGLHTLCLLDIKVKEPSLESLCRWKKVYEPPRFMTINTAIEQLLEVVQNQHDSAYNEDTMCVGLARVGCEDEMIVAGSMKQLLAIDFGPPLHCLVIVGDTH...

XP_057766079.1
MLYIIGLGLGDEKDITLRGLEAIKKCSKVYMEAYTSLLSFGITSDGLSKLEKVYGRPIIVSDREMVEEKADDMLLEAQVSDVAFLVVGDPFGATTHSDLVVRAKKLGVNIKVVHNASVMNAIGVCGLQLYRYGETISIPFFTETWKPDSFYDKIKRNRELGLHTLCLLDIKVKEPSLESLCRWKKVYEPPRFMTINTAIEQLLEVVQNQHDSDTMCVGLARVGCEDEMIVAGSMKQLLAIDFGPPLHCLVIVGDTHPVEQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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