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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001985`

染色体: Chr05 坐标: 20529038-20532136 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001985`
名称	SmilChr05G001985
描述	putative HVA22-like protein g
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20529038 - 20532136 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986635`
GeneID	`130986635`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986635`
原始查询	`SmilChr05G001985`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative HVA22-like protein g
产物	putative HVA22-like protein g
Arabidopsis	`AT5G42560` (AT5G42560) Abscisic acid-responsive (TB2/DP1, HVA22) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834262] identity=50; qcov=1.09; evalue=4.58e-95; confidence=high
Rice	`Os03g0132300` - identity=44.3; qcov=0.982; evalue=2.33e-76; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03134 (TB2_DP1_HVA22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986635

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057766080.1`
2	Nucleus inner membrane	Nucleus inner membrane	1.00000	`XP_057766080.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057766080.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057766080.1`
5	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057766080.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20531051`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A4,B1,B102,B68
`Chr5:20531051`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A4,B1,B102,B68
`Chr5:20531113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B27
`Chr5:20531633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B93,C45,C61,C85,D6
`Chr5:20531792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B93,C45,C61,C85
`Chr5:20531869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C39
`Chr5:20531869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr5:20531900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:20531910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr5:20531971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766080.1

279 aa

140

279

TB2_DP1_HVA22

PF03134 TB2_DP1_HVA22 19-97 aa

XP_057766081.1

279 aa

140

279

TB2_DP1_HVA22

PF03134 TB2_DP1_HVA22 19-97 aa

XP_057766082.1

276 aa

138

276

TB2_DP1_HVA22

PF03134 TB2_DP1_HVA22 19-97 aa

XP_057766084.1

276 aa

138

276

TB2_DP1_HVA22

PF03134 TB2_DP1_HVA22 19-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766080.1`	Pfam	`PF03134`	TB2_DP1_HVA22	Family	19	97	3.3e-24	85.3	TB2/DP1, HVA22 family
`XP_057766081.1`	Pfam	`PF03134`	TB2_DP1_HVA22	Family	19	97	3.3e-24	85.3	TB2/DP1, HVA22 family
`XP_057766082.1`	Pfam	`PF03134`	TB2_DP1_HVA22	Family	19	97	3.3e-24	85.3	TB2/DP1, HVA22 family
`XP_057766084.1`	Pfam	`PF03134`	TB2_DP1_HVA22	Family	19	97	3.3e-24	85.3	TB2/DP1, HVA22 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910097.1
AGACCGTGCTCATCACCGCACATTAATGCTTCCCCTCTCCTCGACTTAAAGATTGATAGAAGTGACGTTCAGTTAATTGCAAAATTTTGAACCGACGTCCAAAAAATCTGCCTGCCTCACGCAACGGTTCGCCGTCGTCTGCGGCAGCGCAAAATTCTCCTTTCACTGCAAATATTTGGACGCAGCCTTCAAATTACTTCCTTTATCAGCAGTAGTCTCTCTCCGCCGCCCTCAACGGCCATTTCTATCTCATTTTTCCT...

XM_057910099.1
AGACCGTGCTCATCACCGCACATTAATGCTTCCCCTCTCCTCGACTTAAAGATTGATAGAAGTGACGTTCAGTTAATTGCAAAATTTTGAACCGACGTCCAAAAAATCTGCCTGCCTCACGCAACGGTTCGCCGTCGTCTGCGGCAGCGCAAAATTCTCCTTTCACTGCAAATATTTGGACGCAGCCTTCAAATTACTTCCTTTATCAGCAGTAGTCTCTCTCCGCCGCCCTCAACGGCCATTTCTATCTCATTTTTCCT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130986635
ATGATTGGATCTCTTCTCACTAGAGGACTTGTAATGGTTCTTGGATATGCTTACCCTGCATATGAATGCTATAAATCTGTGGAGCTGAATAAGCCTGATATCAACCAACTTCGCTTTTGGTGCCAGTACTGGGTCTTAGTGGCGGGCTTGACAATATTTGAAAGAATCGGTGATACATTTATTGGCTGGGTTCCAATGTATGGTGAGGCTAAGTTAGCCTTCTTTATATATCTGTGGTATCCTAAAACTAAGGGAACAAC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057766080.1
MIGSLLTRGLVMVLGYAYPAYECYKSVELNKPDINQLRFWCQYWVLVAGLTIFERIGDTFIGWVPMYGEAKLAFFIYLWYPKTKGTTYVYGSFFRPYIEKHETEIDRNLLELKTRAGDLAFIYWQKTASYAQTRVFDILQFVAAQSTPKRSAQPIQQEAKVRKPSTPSAHGADVTTQPQDEQPFSPASSSSSSEQEEDAADVAESSGEPKAAPAPVVLKEQKTTLSQALVTSSSSIEQVMQIDSVNDTTPTIQETAVTEE...

XP_057766081.1
MIGSLLTRGLVMVLGYAYPAYECYKSVELNKPDINQLRFWCQYWVLVAGLTIFERIGDTFIGWVPMYGEAKLAFFIYLWYPKTKGTTYVYGSFFRPYIEKHETEIDRNLLELKTRAGDLAFIYWQKTASYAQTRVFDILQFVAAQSTPKRSAQPIQQEAKVRKPSTPSAHGADVTTQPQDEQPFSPASSSSSSEQEEDAADVAESSGEPKAAPAPVVLKEQKTTLSQALVTSSSSIEQVMQIDSVNDTTPTIQETAVTEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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