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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G001998`

染色体: Chr05 坐标: 20702475-20703268 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G001998`
名称	SmilChr05G001998
描述	uncharacterized SmilChr05G001998
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20702475 - 20703268 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025636`
GeneID	`131025636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025636`
原始查询	`SmilChr05G001998`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993]; symbol=AT5G28780; hit=AT5G28780; species=arabidopsis; confidence=high
产物	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993]; symbol=AT5G28780; hit=AT5G28780; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G28780` (AT5G28780) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832993] identity=46.1; qcov=1.03; evalue=4.66e-52; confidence=high
Rice	`Os04g0206200` - identity=43.2; qcov=0.849; evalue=5.7e-47; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811416.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811416.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811416.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811416.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811416.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20702562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A21,B106,B107,B111,B119,B135,B64,B69,C6,C87
`Chr5:20702578`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B65
`Chr5:20702578`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B65
`Chr5:20702610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr5:20702667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:20702670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:20702691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:20702768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr5:20702776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,D9
`Chr5:20702800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,C6
`Chr5:20702820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B37,B52,B56,B57,C9
`Chr5:20702821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811416.1

199 aa

100

199

Pif1_2B_dom

PF21530 Pif1_2B_dom 35-81 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811416.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	35	81	1.2e-19	70.4	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955433.1
ATGGTTGATACGATCAATGATTACGTCATGTCTCTGATGTCTAGCAAGGGTATTTGCAAAGAAGATGGACAAGTGGACCTTGATGAACAAGTATTCTCGGTTGAATATCTCAATACAATCAAGTGTTCAGGATTACCGAGTCATGAAATTAAATTGAAAGAAGGATGCATAATAATGCTTCTCAGAAATATTGATCCATCTAATGAGCTTTGCAATGACACCAGGCTGATAGTAACTCAACTTGGGGAATGCGTAATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025636
ATGGTTGATACGATCAATGATTACGTCATGTCTCTGATGTCTAGCAAGGGTATTTGCAAAGAAGATGGACAAGTGGACCTTGATGAACAAGTATTCTCGGTTGAATATCTCAATACAATCAAGTGTTCAGGATTACCGAGTCATGAAATTAAATTGAAAGAAGGATGCATAATAATGCTTCTCAGAAATATTGATCCATCTAATGAGCTTTGCAATGACACCAGGCTGATAGTAACTCAACTTGGGGAATGCGTAATTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811416.1
MVDTINDYVMSLMSSKGICKEDGQVDLDEQVFSVEYLNTIKCSGLPSHEIKLKEGCIIMLLRNIDPSNELCNDTRLIVTQLGECVIEGKLISGKNSGRKFPIARMIMSPSDFAKFPIRFQRRQFPVSVCFAMTINKSQGQSLSNVGLYLPKPVFSHGQLYVAISRVTRKRGLKILVCDESGHTQDTTTNVVYDEIFDRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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