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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002010`

染色体: Chr05 坐标: 20809339-20811790 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002010`
名称	SmilChr05G002010
描述	thaumatin-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	20809339 - 20811790 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986652`
GeneID	`130986652`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986652`
原始查询	`SmilChr05G002010`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thaumatin-like protein 1
产物	thaumatin-like protein 1
Arabidopsis	`AT4G24180` (TLP1) THAUMATIN-LIKE PROTEIN 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828519] identity=58.1; qcov=0.95; evalue=1.32e-119; confidence=high
Rice	`Os09g0536400` - identity=63.4; qcov=0.796; evalue=1.03e-104; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986652

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057766099.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057766099.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766099.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:20809514`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A2,A6,B82,C78
`Chr5:20809514`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A2,A6,B82,C78
`Chr5:20809518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr5:20809527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr5:20809860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B46
`Chr5:20809933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:20809939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:20810196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr5:20811451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A20,A5,B130,B133,B136,B75,B93,C15,C33
`Chr5:20811475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:20811550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr5:20811613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766099.1

319 aa

160

319

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 33-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766099.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	33	244	3.5e-84	282.4	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910116.1
TTTCATCATTCACCCTTCTCCCAAAACCCTCCTCTCTCTTGAAGAAATTCGTATGGGCTATTGCTCTTTTCATCTCCATCAAATTAATATTTTTGCTTCCATCACCACAACACATTTCCCTTCTAATTTTCCCTAATATATAAACATTAAAAAAAAAATCATAATCCTCCAAATGCTGTCGACATTTTCTGCTTTGCACGCTCTCTATGTCACCCTAATATTCCTTATCATGGTCAAAGGAAGTTTAGGGACTTCATTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986652
ATGCTGTCGACATTTTCTGCTTTGCACGCTCTCTATGTCACCCTAATATTCCTTATCATGGTCAAAGGAAGTTTAGGGACTTCATTCCTATTGGTCAACAGATGTGACTACACAGTTTGGCCCGGAATACTATCAAACGCGGGCAGCTCCGGTCTAGACACCACCGGTTTCGAGCTCCCGCCCGGTGCCACCCGGTCCATCAAAGCCCAACCGGGCTGGTCAGGCCGGTTTTGGGGCCGGACCGGCTGCTCATTCGACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766099.1
MLSTFSALHALYVTLIFLIMVKGSLGTSFLLVNRCDYTVWPGILSNAGSSGLDTTGFELPPGATRSIKAQPGWSGRFWGRTGCSFDPATGQGRCATGDCGSNQMECNGAGAAPPATLAEFTVGSSGSQDFYDVSLVDGYNLPMIVEASGGSGACGSTGCMVDLNRMCPEELRAGDGQGCKSACEAFGTAEYCCSGEFGTPEKCRPSPYSEIFKNACPRSYSYAYDDATSIFTCTGPDYTITFCPSLTSKKSSSWSATTNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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