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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002031`

染色体: Chr05 坐标: 21124979-21125848 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002031`
名称	SmilChr05G002031
描述	uncharacterized SmilChr05G002031
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21124979 - 21125848 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025641`
GeneID	`131025641`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025641`
原始查询	`SmilChr05G002031`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0228500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0228500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=25.7; qcov=0.875; evalue=4.15e-14; confidence=low
Rice	`Os12g0228500` - identity=25.3; qcov=0.931; evalue=1.89e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025641

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811423.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811423.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811423.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811423.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811423.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21124985`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A7
`Chr5:21124985`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A7
`Chr5:21124994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C42
`Chr5:21125015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr5:21125019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B56,B68,B79
`Chr5:21125027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C25,C31,C35,C79
`Chr5:21125039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr5:21125044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C79
`Chr5:21125074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,A7,B82
`Chr5:21125083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,B63
`Chr5:21125096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B125,B127,B131,B63,B71,C56,C73
`Chr5:21125097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B69,B71,C31,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811423.1

289 aa

144

289

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 134-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811423.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	134	262	1.1e-07	33.6	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955440.1
ATGGGTGTTCAACAACGCCCAAACAAAAATTATAAAGGGGCAAAAAATGTAGCTTGGTGTGTGAAGGAAGATGTTGCCCTTATGTCATCTTGGATCTATGCTAGCGAAGATAACATTCGAGGAAAAAATCAAAGAGGGGAATCGCTTTGGGCACGTGTTCATAAATTGTATCACAACACCCAAGCAGAAAATCCAAATGAGCTCAACGAACGAAACATTGAATCGATGAAAGGTCGCTGGAAACGTCTTAGCGAAAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025641
ATGGGTGTTCAACAACGCCCAAACAAAAATTATAAAGGGGCAAAAAATGTAGCTTGGTGTGTGAAGGAAGATGTTGCCCTTATGTCATCTTGGATCTATGCTAGCGAAGATAACATTCGAGGAAAAAATCAAAGAGGGGAATCGCTTTGGGCACGTGTTCATAAATTGTATCACAACACCCAAGCAGAAAATCCAAATGAGCTCAACGAACGAAACATTGAATCGATGAAAGGTCGCTGGAAACGTCTTAGCGAAAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811423.1
MGVQQRPNKNYKGAKNVAWCVKEDVALMSSWIYASEDNIRGKNQRGESLWARVHKLYHNTQAENPNELNERNIESMKGRWKRLSENGNKWVAACREANARRRSGMSNNDVEKEAHSIYEAGGNKFLDLVVFNEVMSKHPKWNVHDTTHVFRRQSEDVDDQESGGSSKRSKTSEDGGFSIPSNPETPTSEQSTATRPIGRDKAKRKGKGKVSQSESTHESAVAAELRAMRLTRDAEAELIKTRIELEREKLQRNAMKMKEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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