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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002035`

染色体: Chr05 坐标: 21190932-21195848 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002035`
名称	SmilChr05G002035
描述	probable serine protease EDA2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21190932 - 21195848 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986674`
GeneID	`130986674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986674`
原始查询	`SmilChr05G002035`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable serine protease EDA2
产物	probable serine protease EDA2
Arabidopsis	`AT4G36195` (AT4G36195) Serine carboxypeptidase S28 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829777] identity=64.6; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0511400` (OsProCP3) - identity=68.2; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005773 (vacuole); GO:0006508 (proteolysis); GO:0008239 (dipeptidyl-peptidase activity); GO:0070008 (serine-type exopeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF05577 (Peptidase_S28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057766125.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057766125.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766125.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766125.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21191125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:21191131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:21191198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B46,B89,D11
`Chr5:21192521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr5:21193178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:21194428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr5:21194438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,D11
`Chr5:21194783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C86
`Chr5:21195242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:21195274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr5:21195518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,B93,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766125.1

484 aa

242

484

Peptidase_S28

PF05577 Peptidase_S28 49-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766125.1`	Pfam	`PF05577`	Peptidase_S28	Domain	49	438	2.3e-79	268.0	Serine carboxypeptidase S28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910142.1
GAAATTGGATTACTCACCAGTCACCTCCACTTGAATACCGAACATCAACAGAAAAGTAAAGTAACAATAACAGTCAAAAATATCAAACAGTGGATTCTTATCGCAGTCGGCAGTCGGCACCAATTTCAGAGATAAAAAGCTGGCAGATTTTTTCAACCGGAGAAGCTAAACACGATGAGGTTCGCTGTCCCGGCGCCGGCGTCGATTTCGCTGGCGATTTTAGTGTTGACTTTGGCGGTTGCTTCGGCGCAGCGGCATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986674
ATGAGGTTCGCTGTCCCGGCGCCGGCGTCGATTTCGCTGGCGATTTTAGTGTTGACTTTGGCGGTTGCTTCGGCGCAGCGGCATTTACGGGAGCGGGAGACCAGCAGCAGCAGCTATTTGACCAAGGAAGAGCACTGGATGAATCAAACTATCGATCACTTCTCTCCCTACGACCGCGACCAGTTTGCTCAACGTTATTATGAATATCTTGATGAGTTTCGGTCTCATGATAGTCCAATATTTCTTAAGATCTGTGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766125.1
MRFAVPAPASISLAILVLTLAVASAQRHLRERETSSSSYLTKEEHWMNQTIDHFSPYDRDQFAQRYYEYLDEFRSHDSPIFLKICGESVCNGISNDYLGVLAKKFGAAVVSLEHRYYGKSYPFGSFSTDNLRYLSSKQALFDLAVFRQYYQESLNEKLNKSTDNPWFVFGISYAGALSAWFRLKFPHLTCGSLASSGVVLAVYNFTKFDEQVGESAGAECKAVLQEITSLVEQRLESNQKDLKKLFNASKLSKDGDFLYF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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