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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002038`

染色体: Chr05 坐标: 21200022-21205469 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002038`
名称	SmilChr05G002038
描述	PHAF1 protein At3g51130
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21200022 - 21205469 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986675`
GeneID	`130986675`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986675`
原始查询	`SmilChr05G002038`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PHAF1 protein At3g51130
产物	PHAF1 protein At3g51130
Arabidopsis	`AT3G51130` (AT3G51130) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824277] identity=80.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0714000` - identity=81.8; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03676 (PHAF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986675

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766126.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057766126.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057766126.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766126.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21200699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr5:21200740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B132,B66
`Chr5:21201136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C34
`Chr5:21203295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C16
`Chr5:21203344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:21203391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A8,C82
`Chr5:21203850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C4
`Chr5:21203859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:21205109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766126.1

403 aa

202

403

PHAF1

PF03676 PHAF1 26-401 aa

XP_057766127.1

403 aa

202

403

PHAF1

PF03676 PHAF1 26-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766126.1`	Pfam	`PF03676`	PHAF1	Family	26	401	4.2e-139	464.9	Phagosome assembly factor 1
`XP_057766127.1`	Pfam	`PF03676`	PHAF1	Family	26	401	4.2e-139	464.9	Phagosome assembly factor 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910144.1
AGAAGCAAAATTAATGAGTAAAAAAAAAAAGTTAATTGGCCCGAAACCAAAAGTTCGGCCCGATTGATGCCTGCAAGCAAAGGCCGCTTCTCCCACAATTCAAGCAAAAATGCCAATTTGTTTGGCAACATACACGAAATTGGACAAAAAGGGGCAACTGAATGCCGTTTCAGTTCACAATTTGCGAATTTCATTAATAGCAATCATCATTCAAGCTGAAAACAGGTCAAATTTGAAGTGATTGGCATACACAGAGTAAA...

XM_057910143.1
CAAAAGTTCGGCCCGATTGATGCCTGCAAGCAAAGGCCGCTTCTCCCACAATTCAAGCAAAAATGCCAATTTGTTTGGCAACATACACGAAATTGGACAAAAAGGGGCAACTGAATGCCGTTTCAGTTCACAATTTGCGAATTTCATTAATAGCAATCATCATTCAAGCTGAAAACAGGTCAAATTTGAAGTGATTGGCATACACAGAGTAAAGGGGGAATATGCAGAGAAACAGACGGAGGTGTGAGAGCACTGCTATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986675
ATGCAGAGAAACAGACGGAGGTGTGAGAGCACTGCTATGGTTTCCATCATCCTCGATCTCCGGCCCGGCGTCGGACTCGGCCCGTTCTCTCTCGGGATGCCAATCTGCGAAGCTTTTGCTCAGATAGAACAGCAGCCCAATATTTACGATGTTGTTCATGTCAAGTACTATGATGAGGAGCCTCTGAAACTTGACATTGTTATTAGCTTACCTGACCATGGGTTTCATCTTAGGTTTGATCCTTGGTCTCAGCGCCTGCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766126.1
MQRNRRRCESTAMVSIILDLRPGVGLGPFSLGMPICEAFAQIEQQPNIYDVVHVKYYDEEPLKLDIVISLPDHGFHLRFDPWSQRLRLIEIFDIKRLQMRYATSLIGGASTLATFVAVYALFGPTYPGVYDKDRGVYTLFYPGLSFAFPIPSQYAQCCHDREAELPLEFPDGTTPVTCRVSIYDSSTDRKVGVGSSMMKACVPPLAAGSLYMEEVVVKLGEELWFTVGGQHISFGASPQDVWTELGRPCGIHQKQVDQMV...

XP_057766127.1
MQRNRRRCESTAMVSIILDLRPGVGLGPFSLGMPICEAFAQIEQQPNIYDVVHVKYYDEEPLKLDIVISLPDHGFHLRFDPWSQRLRLIEIFDIKRLQMRYATSLIGGASTLATFVAVYALFGPTYPGVYDKDRGVYTLFYPGLSFAFPIPSQYAQCCHDREAELPLEFPDGTTPVTCRVSIYDSSTDRKVGVGSSMMKACVPPLAAGSLYMEEVVVKLGEELWFTVGGQHISFGASPQDVWTELGRPCGIHQKQVDQMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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