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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002039`

染色体: Chr05 坐标: 21221977-21230654 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002039`
名称	SmilChr05G002039
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 44-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21221977 - 21230654 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986678`
GeneID	`130986678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986678`
原始查询	`SmilChr05G002039`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 44-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 44-like
Arabidopsis	`AT3G51120` (AT3G51120) zinc finger CCCH domain-containing protein 44 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824276] identity=45.4; qcov=0.356; evalue=1.64e-122; confidence=low
Rice	`Os09g0530500` - identity=43.5; qcov=0.293; evalue=8.36e-108; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF02201 (SWIB); PF02213 (GYF); PF03126 (Plus-3); PF25980 (NERD_plant)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766129.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766129.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766129.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766129.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766129.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21222495`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C17
`Chr5:21222495`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C17
`Chr5:21222688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:21225155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:21225381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B93,C46
`Chr5:21225847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B122,C4
`Chr5:21225950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C23
`Chr5:21225951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C34
`Chr5:21226173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr5:21226179`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr5:21226179`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr5:21227702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766129.1

1527 aa

764

1527

SWIB

Plus-3

NERD_plant

GYF

PF02201 SWIB 397-470 aa PF03126 Plus-3 537-640 aa PF25980 NERD_plant 663-709 aa PF02213 GYF 840-880 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766129.1`	Pfam	`PF02201`	SWIB	Domain	397	470	5.1e-14	52.5	SWIB/MDM2 domain
`XP_057766129.1`	Pfam	`PF03126`	Plus-3	Domain	537	640	4e-22	79.5	Plus-3 domain
`XP_057766129.1`	Pfam	`PF25980`	NERD_plant	Domain	663	709	2.2e-11	44.1	Plant NERD domain
`XP_057766129.1`	Pfam	`PF02213`	GYF	Domain	840	880	4.7e-08	33.3	GYF domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910146.1
TAAGAAAAGAAGCGACGGAGTATAGTATATAATTGAGTCCCAATTCTTTTCCGGCCCCACCACCGTGACGCGCGGCCGTGCTTTGACTCTGCCGCATTTCATCATGCACTTGGTTAGTTGGGGTGGGGAAGGGGGGAGGTAGGCTACTCAAATTCCACTAATTTCCAAACTCTAGTCATATTTAAAAGTTTGGTTTTACCATTACAGCTAGAAAAAGGAAAAGTACACACTGAATTCATTACACCCCACCTCCATCTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986678
ATGGAGAATATAGAGACGCTGTTAGCTGCCGTGGCTCAGACCACGGGCTTCGGCGACGAGGAGCCGGTTGTTGCTACTCCGTCGGAGCTAGGGTTGGAGAGTTCTGGGTCTCCGGCGGGTGATGAGGTTGCCGGAGTTGTGCAGCCTTCTCCGGTGGTGGGTGGGGTTGTTTCAGATCTGATGGCTGCTGCTCCGACTCCGGTGAGTGCGAACGGCACCGGTGAGAAGCGGAAGCGGGGACGGCCGCCTAAGGGGCAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766129.1
MENIETLLAAVAQTTGFGDEEPVVATPSELGLESSGSPAGDEVAGVVQPSPVVGGVVSDLMAAAPTPVSANGTGEKRKRGRPPKGQLTAKPPPIKRVKVEDEEEDVCFICFDGGSLVLCDRKGCPKAYHPACIKRDEAFFKSKAKWNCGWHICSGCRKTSHYMCYTCTYSLCKGCTKDADFVSVRGNKGFCSTCMKTIMLIENKDQAANDSIQVDFDDKLSWEYLFKMYWVILKENLSLTLSELTQAKRPWKGVAAVTRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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