当前解析结果
SmilChr05G002043| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002043 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002043 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002043 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 21269243 - 21274259 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986682 |
|---|---|
| GeneID | 130986682 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986682 |
| 原始查询 | SmilChr05G002043 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | altered inheritance of mitochondria protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824274]; symbol=AT3G51100; hit=AT3G51100; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | altered inheritance of mitochondria protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824274]; symbol=AT3G51100; hit=AT3G51100; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G51100 (AT3G51100)altered inheritance of mitochondria protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824274] identity=48.9; qcov=0.814; evalue=5.55e-57; confidence=high |
| Rice | Os06g0713900- identity=50.6; qcov=0.735; evalue=2.49e-56; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF26631 (DUF8204) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986682 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057766136.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057766136.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057766136.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057766136.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766136.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:21272384 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr5:21273903 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A23,B1,B2,B56,B96 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766136.1PF26631
DUF8204 62-153 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766136.1 |
Pfam | PF26631 |
DUF8204 | Domain | 62 | 153 | 1.9e-41 | 141.1 | Domain of unknown function (DUF8204) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。