当前解析结果
SmilChr05G002047| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002047 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002047 |
| 描述 | protein FMP32, mitochondrial-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 21288760 - 21292660 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986684 |
|---|---|
| GeneID | 130986684 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986684 |
| 原始查询 | SmilChr05G002047 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein FMP32, mitochondrial-like |
| 产物 | protein FMP32%2C mitochondrial-like |
| Arabidopsis | AT2G16460 (AT2G16460)coiled-coil 90B-like protein (DUF1640) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816144] identity=77.6; qcov=0.901; evalue=1.88e-108; confidence=high |
| Rice | Os06g0713100- identity=66.5; qcov=1.07; evalue=6.98e-108; confidence=high |
| GO | GO:0005739 (mitochondrion) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF07798 (CCDC90-like) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986684 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057766137.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.80000 | XP_057766137.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.80000 | XP_057766137.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057766137.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766137.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766137.1PF07798
CCDC90-like 38-211 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766137.1 |
Pfam | PF07798 |
CCDC90-like | Family | 38 | 211 | 3.1e-57 | 193.9 | Coiled-coil domain-containing protein 90-like |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。