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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002066`

染色体: Chr05 坐标: 21521851-21523772 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002066`
名称	SmilChr05G002066
描述	F-box protein At5g49610-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21521851 - 21523772 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986697`
GeneID	`130986697`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986697`
原始查询	`SmilChr05G002066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g49610-like
产物	F-box protein At5g49610-like
Arabidopsis	`AT5G03970` (AT5G03970) F-box associated ubiquitination effector family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830276] identity=22.9; qcov=0.722; evalue=3.51e-10; confidence=weak
Rice	`Os03g0776400` - identity=25.6; qcov=0.814; evalue=9.57e-19; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF07734 (FBA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986697

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057766150.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057766150.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057766150.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057766150.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766150.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21521984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr5:21522357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:21522467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr5:21522532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B46,B59,B89
`Chr5:21522589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:21522677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C9,D10
`Chr5:21522688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B79
`Chr5:21522781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C85
`Chr5:21522829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B35
`Chr5:21522839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766150.1

345 aa

172

345

F-box

FBA_1

PF00646 F-box 18-48 aa PF07734 FBA_1 98-212 aa

XP_057766151.1

345 aa

172

345

F-box

FBA_1

PF00646 F-box 18-48 aa PF07734 FBA_1 98-212 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766150.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	18	48	0.00031	21.3	F-box domain
`XP_057766150.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	98	212	4.8e-11	43.0	F-box associated beta propeller domain
`XP_057766151.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	18	48	0.00031	21.3	F-box domain
`XP_057766151.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	98	212	4.8e-11	43.0	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910168.1
GAAGTTAATTAACGCGCAAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAATCTATTGCGAAATTTCCCCTGCAGTCTGACGAAAACCGTGAATTTCTTCGTAATTCTCAAGAAGATAAGAAGCACGTAGTCGGAGATGGAGATGGATCCATTGGTGATGAAGGTGAAGCTGAAAGATGTAGTGAGGGAGAGGGTCCTCCCCTTCCTCCCTGCCAAATCCCTCCTCCGTTTCATGTCCGTTTCCAAGGAATGGAAGGGATGGATC...

XM_057910167.1
GAATCTATTGCGAAATTTCCCCTGCAGTCTGACGAAAACCGTGAATTTCTTCGTAATTCTCAGTAGGCCCTCTCTCTCTCTCTAGGTTAGGATAAAAGAGTACGTGTTTATCATTTCTGTGTTTTCATAGAGTTCAAAAAAATTCGCTTTAGAAGACTATTGTGAGTGTTGACGAGAAGATAAGAAGCACGTAGTCGGAGATGGAGATGGATCCATTGGTGATGAAGGTGAAGCTGAAAGATGTAGTGAGGGAGAGGGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986697
ATGGAGATGGATCCATTGGTGATGAAGGTGAAGCTGAAAGATGTAGTGAGGGAGAGGGTCCTCCCCTTCCTCCCTGCCAAATCCCTCCTCCGTTTCATGTCCGTTTCCAAGGAATGGAAGGGATGGATCAACAGCCCTCTCCTCGCCTTCCATCAGAGCCACTACTTCAACAAACTCTCCGGTTTCTTCGCCCAAACCCAAACAACTGATCCCACATTCATCACCTTGGACGCTTCTGCTTACGGAGTTGCAATGCCTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766150.1
MEMDPLVMKVKLKDVVRERVLPFLPAKSLLRFMSVSKEWKGWINSPLLAFHQSHYFNKLSGFFAQTQTTDPTFITLDASAYGVAMPNLRFLPEPVHIATSCSGLLVCLGRESDSYYICNPASKAWAPLPQPLLYHQYGARAILAFEPSARNIEQRYQLICAVPLPGGELSFELYSSATKSWTVLNTTLPDMENLRMIGNGLYMKGVAYWLTDAGMVIAYDVERELHDLIPVESSDGVLAQMAGELCYITMSHLTGSRYKI...

XP_057766151.1
MEMDPLVMKVKLKDVVRERVLPFLPAKSLLRFMSVSKEWKGWINSPLLAFHQSHYFNKLSGFFAQTQTTDPTFITLDASAYGVAMPNLRFLPEPVHIATSCSGLLVCLGRESDSYYICNPASKAWAPLPQPLLYHQYGARAILAFEPSARNIEQRYQLICAVPLPGGELSFELYSSATKSWTVLNTTLPDMENLRMIGNGLYMKGVAYWLTDAGMVIAYDVERELHDLIPVESSDGVLAQMAGELCYITMSHLTGSRYKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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