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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002075`

染色体: Chr05 坐标: 21676812-21685457 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002075`
名称	SmilChr05G002075
描述	protein MICRORCHIDIA 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21676812 - 21685457 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986705`
GeneID	`130986705`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986705`
原始查询	`SmilChr05G002075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MICRORCHIDIA 3-like
产物	protein MICRORCHIDIA 3-like
Arabidopsis	`AT4G36280` (CRH1) Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829785] identity=55.4; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0181700` - identity=51.2; qcov=1.04; evalue=2.04e-177; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF02518 (HATPase_c); PF13589 (HATPase_c_3); PF17942 (Morc6_S5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986705

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766164.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057766164.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057766164.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766164.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766164.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21677130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B16,B65,C14
`Chr5:21677637`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A14,B11
`Chr5:21677637`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A14,B11
`Chr5:21678310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B54
`Chr5:21679322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,C3
`Chr5:21680362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:21682815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A21,A6,B82,C78
`Chr5:21684960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B37,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766164.1

600 aa

300

600

HATPase_c_3

HATPase_c

Morc6_S5

PF13589 HATPase_c_3 115-224 aa PF02518 HATPase_c 117-195 aa PF17942 Morc6_S5 345-484 aa

XP_057766165.1

506 aa

253

506

HATPase_c_3

Morc6_S5

PF13589 HATPase_c_3 38-130 aa PF17942 Morc6_S5 251-390 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766164.1`	Pfam	`PF13589`	HATPase_c_3	Domain	115	224	1.7e-15	58.0	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
`XP_057766164.1`	Pfam	`PF02518`	HATPase_c	Domain	117	195	2e-06	28.9	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
`XP_057766164.1`	Pfam	`PF17942`	Morc6_S5	Domain	345	484	4.2e-60	202.5	Morc6 ribosomal protein S5 domain 2-like
`XP_057766165.1`	Pfam	`PF13589`	HATPase_c_3	Domain	38	130	5.4e-12	46.6	Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase
`XP_057766165.1`	Pfam	`PF17942`	Morc6_S5	Domain	251	390	3.4e-60	202.8	Morc6 ribosomal protein S5 domain 2-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910181.1
GAGTTTAATTTCTCCCAAAATAAGACTTCAGTCCTCGAATTTCTTGCGTCTCATAATTCTTTTTCCCGAATTTCTGTGTTCAATCGCGGGAAAATATGCCGCCGAAGCAACAGAAGCGAATTCCGGCGACCGCTGAAGTTGTCGACCTCGACAGTAGCGACGAAGAAGGCGGCGGAGCTCCAGCGAACTGCAAACCTGCTAATAGCGAGAAATTGCAAGCGAAGCCACCTGGTATTGGCGCAGCTCAGCCGGCCTCGGCC...

XM_057910182.1
GTCAATTGAAAATCGAAGTTTCTGGAAAGCCGGAGCTTATGAAATTGGCACCACGAAATCTACTCTAATACAAGGTGATCTGGAGCATGCACGTGTTCATCCCAAGTTTCTACACTCTAACGCCACCTCTCACAAATGGGCATTCGGAGCTATTGCTGAGCTATTGGACAATGCTGTGGATGAGCCAGATAGAAAATGGTGCAACTTTTGTGAAGGTAGACCGGATTTATAACACAAAGGATAATAGTCCTGCCTTACTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986705
ATGCCGCCGAAGCAACAGAAGCGAATTCCGGCGACCGCTGAAGTTGTCGACCTCGACAGTAGCGACGAAGAAGGCGGCGGAGCTCCAGCGAACTGCAAACCTGCTAATAGCGAGAAATTGCAAGCGAAGCCACCTGGTATTGGCGCAGCTCAGCCGGCCTCGGCCGCCAACAGTGGCGACGTGTCGGCGGTGAATAATCGGTCAATTGAAAATCGAAGTTTCTGGAAAGCCGGAGCTTATGAAATTGGCACCACGAAATC...

LOC130986705
ATGCACGTGTTCATCCCAAGTTTCTACACTCTAACGCCACCTCTCACAAATGGGCATTCGGAGCTATTGCTGAGCTATTGGACAATGCTGTGGATGAGCCAGATAGAAAATGGTGCAACTTTTGTGAAGGTAGACCGGATTTATAACACAAAGGATAATAGTCCTGCCTTACTTTTCCAAGATGATGGGGGTGGAATGGATCCAGAAAGGATGCGGAAGTGTATGAGCTTGGGTTACTCATCAAAGACATCTAATACAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766164.1
MPPKQQKRIPATAEVVDLDSSDEEGGGAPANCKPANSEKLQAKPPGIGAAQPASAANSGDVSAVNNRSIENRSFWKAGAYEIGTTKSTLIQGDLEHARVHPKFLHSNATSHKWAFGAIAELLDNAVDEIENGATFVKVDRIYNTKDNSPALLFQDDGGGMDPERMRKCMSLGYSSKTSNTTIGQYGNGFKTSTMRLGADVIVFSRSNRSGRATQSIGLLSYTFLRRTGQDDVIVPMIDFDISDNWAEPIIYSSKDDWSIN...

XP_057766165.1
MHVFIPSFYTLTPPLTNGHSELLLSYWTMLWMSQIENGATFVKVDRIYNTKDNSPALLFQDDGGGMDPERMRKCMSLGYSSKTSNTTIGQYGNGFKTSTMRLGADVIVFSRSNRSGRATQSIGLLSYTFLRRTGQDDVIVPMIDFDISDNWAEPIIYSSKDDWSINLKTILEWSPFASKDDLMLQFGNLGSHGTKVIIYNLWMNDEGIYELNFDDDHEDIRLRDEANHGTTTKTIKKVLELKSHLSYRIRFSLRAYASIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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