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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002077`

染色体: Chr05 坐标: 21707662-21709732 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002077`
名称	SmilChr05G002077
描述	protein RTE1-HOMOLOG
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21707662 - 21709732 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986707`
GeneID	`130986707`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986707`
原始查询	`SmilChr05G002077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RTE1-HOMOLOG
产物	protein RTE1-HOMOLOG
Arabidopsis	`AT3G51040` (RTH) RTE1-homolog [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824268] identity=57.3; qcov=0.996; evalue=1.44e-89; confidence=high
Rice	`Os03g0799500` (OsRTH3) - identity=53.5; qcov=0.952; evalue=4.58e-84; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0009723 (response to ethylene); GO:0010104 (regulation of ethylene-activated signaling pathway)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05608 (RTE1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986707

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057766166.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057766166.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057766166.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766166.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21708346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B21,B46,B59,B89
`Chr5:21708891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr5:21709064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766166.1

228 aa

114

228

RTE1

PF05608 RTE1 22-170 aa

XP_057766167.1

228 aa

114

228

RTE1

PF05608 RTE1 22-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766166.1`	Pfam	`PF05608`	RTE1	Domain	22	170	8.6e-67	224.6	RTE1-like
`XP_057766167.1`	Pfam	`PF05608`	RTE1	Domain	22	170	8.6e-67	224.6	RTE1-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910183.1
TTTTAATATGGAAGAATATTTCCAAGCTAATTAGTAGCTAAGATTTCTTCTTTTACCAATCTTCTTCCCCGCTTTAGCAGATCGTAACAGTTCTAGAACTTCGAATTCCACCCGATCCAGCGCCGGCTGCCTACGTCGTCGTTTCTCCTCCACATAAGGTTTGGGAATACATCAGAGTTCTTCAATATAGGCAATGGGATCAAATGAAGAGCATAGTTTGACCATTGAAGAGAACGAGACCGAGTTGAAGCAAATTGATC...

XM_057910184.1
TGGAAGAATATTTCCAAGCTAATTAGTAGCTAAGATTTCTTCTTTTACCAATCTTCTTCCCCGCTTTAGCAGATCGTAACAGTTCTAGAACTTCGAATTCCACCCGATCCAGCGCCGGCTGCCTACGTCGTCGTTTCTCCTCCACATAAGATATTTTGAGGGAGTTTTCCTTTTTTAGGTTTGGGAATACATCAGAGTTCTTCAATATAGGCAATGGGATCAAATGAAGAGCATAGTTTGACCATTGAAGAGAACGAGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986707
ATGGGATCAAATGAAGAGCATAGTTTGACCATTGAAGAGAACGAGACCGAGTTGAAGCAAATTGATCCAGCTAGAAGCCGATTTCCTTGCTGCATTGTGTGGACGCCGCTCCCTCTGCTATCGTGGTTCTTCCCTTGCATTGGTCACATCGGGATATGCAGGGACGATGGAGTCATCTTGGACTTTGCGGGGCCTAATTTCGTGTGCGTTGATAATTTCGCATTCGGTGCGCCAACACGGTACCTGCAGCTAAGCAAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766166.1
MGSNEEHSLTIEENETELKQIDPARSRFPCCIVWTPLPLLSWFFPCIGHIGICRDDGVILDFAGPNFVCVDNFAFGAPTRYLQLSKEQCCTFLDSPAQDPEGETLQGGDGREIATWDDTLRKSTLEYQHQSYNILTCNCHSFVANCLNRLKFQAGNWNVVSLAVLVFMKGRFVSRLAILQTYLPFVIVLGLGLIFGGEVFLTYLFIFICVLVGWFLLGTYCFKKLIYV

XP_057766167.1
MGSNEEHSLTIEENETELKQIDPARSRFPCCIVWTPLPLLSWFFPCIGHIGICRDDGVILDFAGPNFVCVDNFAFGAPTRYLQLSKEQCCTFLDSPAQDPEGETLQGGDGREIATWDDTLRKSTLEYQHQSYNILTCNCHSFVANCLNRLKFQAGNWNVVSLAVLVFMKGRFVSRLAILQTYLPFVIVLGLGLIFGGEVFLTYLFIFICVLVGWFLLGTYCFKKLIYV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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