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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002081`

染色体: Chr05 坐标: 21744620-21746183 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002081`
名称	SmilChr05G002081
描述	thioredoxin H1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	21744620 - 21746183 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986712`
GeneID	`130986712`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986712`
原始查询	`SmilChr05G002081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin H1
产物	thioredoxin H1
Arabidopsis	`AT3G51030` (TRX1) thioredoxin H-type 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824267] identity=84.1; qcov=0.934; evalue=3.17e-67; confidence=high
Rice	`Os07g0186000` (TRXH) - identity=60.3; qcov=0.959; evalue=5.37e-49; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF13098 (Thioredoxin_2); PF13899 (Thioredoxin_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986712

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766174.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766174.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766174.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766174.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766174.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:21746044`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C86
`Chr5:21746044`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766174.1

121 aa

121

Thioredoxin

Thioredoxin_7

Thioredoxin_2

PF00085 Thioredoxin 13-112 aa PF13899 Thioredoxin_7 17-48 aa PF13098 Thioredoxin_2 20-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766174.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	13	112	1e-30	106.5	Thioredoxin
`XP_057766174.1`	Pfam	`PF13899`	Thioredoxin_7	Domain	17	48	3.1e-06	27.9	Thioredoxin-like
`XP_057766174.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	20	111	4.2e-09	37.5	Thioredoxin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910191.1
TTTAATAGGAAAGAAAATCAAGATAAAAACAAATAAGTCCAGCTGGCATATATATGCGTGTATTCCTGTATATATAAATGCGCGCGGTACACACTGCACCAATGCATTAAAGCTAATAAGGAGTGTTTTCTTGTGTGATAAGTTTTGAGGGAGAGAGAGAAGAAGAAATGTCTGCGTCGGAATCTGAAGGACAGGTTATCGGCTGCCACACTGATGCTACCTGGAACGAGCAGCTTCAGAAGGCAAATGAAAACAAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986712
ATGTCTGCGTCGGAATCTGAAGGACAGGTTATCGGCTGCCACACTGATGCTACCTGGAACGAGCAGCTTCAGAAGGCAAATGAAAACAAGAAGTTGGTAGTTGTGGACTTCACTGCTTCCTGGTGCGGACCCTGTCGGTTCATCGCTCCATTCTTTGCGGAGTTGGCCAAAAAGTTTCCTTCAGTGATGTTCCTCAAAGTGGATATCGATGAGTTGAAGTCGGTTGCTAGTGACTGGGCAGTGGAGGCAATGCCAACCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766174.1
MSASESEGQVIGCHTDATWNEQLQKANENKKLVVVDFTASWCGPCRFIAPFFAELAKKFPSVMFLKVDIDELKSVASDWAVEAMPTFIFLKEGKILDTIVGAKKEELQQTIAKHLNTATTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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