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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr05G002091

染色体: Chr05 坐标: 21887826-21894123 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr05G002091
名称SmilChr05G002091
描述uncharacterized SmilChr05G002091
染色体 / SeqIDChr05 / NC_080391.1
坐标与链方向21887826 - 21894123 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130986721
GeneID130986721
locus_tag-
NCBI NameLOC130986721
原始查询SmilChr05G002091

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述G-protein coupled receptor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829796]; symbol=AT4G36440; hit=AT4G36440; species=arabidopsis; confidence=high
产物G-protein coupled receptor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829796]; symbol=AT4G36440; hit=AT4G36440; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT4G36440 (AT4G36440)
G-protein coupled receptor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829796]
identity=55.5; qcov=0.973; evalue=6.57e-164; confidence=high
RiceOs01g0262700 (P0469E09.26-1)
-
identity=52; qcov=0.718; evalue=1.27e-111; confidence=high
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130986721

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cell membrane 细胞膜 1.00000 XP_057766194.1
2 Cytoplasmic vesicle 细胞质囊泡 0.20000 XP_057766195.1
3 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057766194.1
4 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057766194.1
5 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057766194.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr5:21888180 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A15,B108,C2,C40,D1
Chr5:21888718 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B94
Chr5:21888922 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B5,B83,C10,C52,C59
Chr5:21890058 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A2,A21,A6,B82,C78
Chr5:21891859 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B130,B136,C33
Chr5:21891865 T TTA 2bp_insertion frameshift_variant 1 B75
Chr5:21891865 T TTA 2bp_insertion CDS_variant 1 B75
Chr5:21891885 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C38
Chr5:21893031 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C7
Chr5:21893052 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057910211.1
TAGGAAGCCCGTTAAGCAGTTTCCACCAAAAGCTTCAGTTATATCGCCGATGTCACAATCCGACGTCGTTAACTACCTCGCCTAAAATTTTCAGATTTTTCTGCTGATGCGATGCATGGATTATTGGCTGCAGTAATTACTGCTGCTATTTTTGGCGCAATTGGAGCCGGTTGTGTGGCCGTACCAAGTACTAGTTGCTACGTCCTCGATAACACCAGCCATATTTATGATTTTAGTACTTTGGTTGGACAACTTTTCGA...
XM_057910212.1
TCCACCAAAAGCTTCAGTTATATCGCCGATGTCACAATCCGACGTCGTTAACTACCTCGCCTAAAATTTTCAGGTGCCTTTCATTCCCATCTGTTCTCTCTCTCAAATTTCTCACACTTGGTAGTTGGTACAATCATTTTGGATTAATAACAATTTGTACACAATCTGAAGCTCAAAAATTGCAACGAGTTGCGATTTTTCTCTGGCGAAATTCGGGATGACGAATTATTTATGGCTCTAGTTGAATCTTGATATGAATT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC130986721
ATGTTGATTTCGGGCAGGACAGATTTTTCTGCTGATGCGATGCATGGATTATTGGCTGCAGTAATTACTGCTGCTATTTTTGGCGCAATTGGAGCCGGTTGTGTGGCCGTACCAAGTACTAGTTGCTACGTCCTCGATAACACCAGCCATATTTATGATTTTAGTACTTTGGTTGGACAACTTTTCGAGTATGACGATGAGAAGGATCCAGATTTGGTGGTACGGTTCTGTAAAGATATCGAGACTAGATCCCAGCCGGG...
LOC130986721
ATGCATGGATTATTGGCTGCAGTAATTACTGCTGCTATTTTTGGCGCAATTGGAGCCGGTTGTGTGGCCGTACCAAGTACTAGTTGCTACGTCCTCGATAACACCAGCCATATTTATGATTTTAGTACTTTGGTTGGACAACTTTTCGAGTATGACGATGAGAAGGATCCAGATTTGGTGGTACGGTTCTGTAAAGATATCGAGACTAGATCCCAGCCGGGATATGTAGATTTTGGAAGATATGATAGTCTCAATTATTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057766194.1
MHGLLAAVITAAIFGAIGAGCVAVPSTSCYVLDNTSHIYDFSTLVGQLFEYDDEKDPDLVVRFCKDIETRSQPGYVDFGRYDSLNYFIASAGRGNFLQEYFNGDIRNCEKTYDKLGRTAQVNIICGSCPNGQCVGGLGCICNVTYESPCRVLIDLALPCVKPGLRVFEGFTVGFHPRSWEVVYNGLTQVGYEKVYDEFSFSTEQRDVTLYLTAVASLSSLVQKPTIKISPKEGLNVKLSGSGAKGSPPTTLSPTMITVDW...
XP_057766195.1
MLISGRTDFSADAMHGLLAAVITAAIFGAIGAGCVAVPSTSCYVLDNTSHIYDFSTLVGQLFEYDDEKDPDLVVRFCKDIETRSQPGYVDFGRYDSLNYFIASAGRGNFLQEYFNGDIRNCEKTYDKLGRTAQVNIICGSCPNGQCVGGLGCICNVTYESPCRVLIDLALPCVKPGLRVFEGFTVGFHPRSWEVVYNGLTQVGYEKVYDEFSFSTEQRDVTLYLTAVASLSSLVQKPTIKISPKEGLNVKLSGSGAKGSP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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