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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002114`

染色体: Chr05 坐标: 22169103-22175351 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002114`
名称	SmilChr05G002114
描述	3'-5' exonuclease
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22169103 - 22175351 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986739`
GeneID	`130986739`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986739`
原始查询	`SmilChr05G002114`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3'-5' exonuclease
产物	3'-5' exonuclease
Arabidopsis	`AT4G13870` (WRNEXO) Werner syndrome-like exonuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827021] identity=45.7; qcov=0.918; evalue=8.02e-85; confidence=high
Rice	`Os04g0129200` - identity=53.6; qcov=0.592; evalue=9.74e-72; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0006139 (nucleobase-containing compound metabolic process); GO:0008408 (3'-5' exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF01612 (DNA_pol_A_exo1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986739

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057766222.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766225.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057766224.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766225.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766225.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22169535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:22169797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr5:22172080`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B71
`Chr5:22172080`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766222.1

335 aa

168

335

DNA_pol_A_exo1

PF01612 DNA_pol_A_exo1 155-319 aa

XP_057766224.1

332 aa

166

332

DNA_pol_A_exo1

PF01612 DNA_pol_A_exo1 152-316 aa

XP_057766225.1

331 aa

166

331

DNA_pol_A_exo1

PF01612 DNA_pol_A_exo1 151-315 aa

XP_057766226.1

331 aa

166

331

DNA_pol_A_exo1

PF01612 DNA_pol_A_exo1 151-315 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766222.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	155	319	4.4e-18	66.4	3'-5' exonuclease
`XP_057766224.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	152	316	4.3e-18	66.4	3'-5' exonuclease
`XP_057766225.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	151	315	4.2e-18	66.5	3'-5' exonuclease
`XP_057766226.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	151	315	4.2e-18	66.5	3'-5' exonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089356.1
GATAATATTAACTCACGGTTTAAAGGAAAACTTGGCCGCCTCCCTCTACTCTTCTCTGTATTTGAAATTATTCTTCCCGGTTAATCGCCGATTAAACCCAATGATTTCCGATATTCATTTTCACCGATGAAACTCGACCTTCTCCCTTCCTCACAACGTAGCTCTCACTGTCCGACCTCATCCCACGGCGTTCTGAAACTGCCATTTACAGCATCAAGTTATAAAGTGCTCGTGAAGCAACATGCAAAATGCACAGAAAA...

XM_057910239.1
GATAATATTAACTCACGGTTTAAAGGAAAACTTGGCCGCCTCCCTCTACTCTTCTCTGTATTTGAAATTATTCTTCCCGGTTAATCGCCGATTAAACCCAATGATTTCCGATATTCATTTTCACCGATGAAACTCGACCTTCTCCCTTCCTCACAACGTAGCTCTCACTGTCCGACCTCATCCCACGGCGTTCTGAAACTGCCATTTACAGCATCAAGTTATAAAGTGCTCGTGAAGCAACATGCAAAATGCACAGAAAA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130986739
ATGCAAAATGCACAGAAAATGGCTATACATCGAAGCCTCCTCTTGGGAGGTAGCAGATACGACTTTAAAGGGCCCGCGCAATTGCGAAAATTTTCGAGAATGGGGGAAATGCCCAATTCAGATTCTGATTGGTATCATCCCCTCACCGATGAAGATCTCCGCGCCATCGACTCCGTGATTTCCTCCGCTCTGCCGCCGAAGCGCCACCGGCACGACAATGCCTCCGCCCACTCTCCGCCCAAGCTGAGGCGACGGTTGCC...

LOC130986739
ATGCAAAATGCACAGAAAATGGCTATACATCGAAGCCTCCTCTTCAGATACGACTTTAAAGGGCCCGCGCAATTGCGAAAATTTTCGAGAATGGGGGAAATGCCCAATTCAGATTCTGATTGGTATCATCCCCTCACCGATGAAGATCTCCGCGCCATCGACTCCGTGATTTCCTCCGCTCTGCCGCCGAAGCGCCACCGGCACGACAATGCCTCCGCCCACTCTCCGCCCAAGCTGAGGCGACGGTTGCCCAGCTCTCT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057766222.1
MQNAQKMAIHRSLLLGGSRYDFKGPAQLRKFSRMGEMPNSDSDWYHPLTDEDLRAIDSVISSALPPKRHRHDNASAHSPPKLRRRLPSSLFVFQQQQQQQRGFNISTVPFSSCSSRYHGTNRSPVSPFQEIKFGGHIIYSRTMKEVERSAQELLDFVEAKKRNGGQCFLGLDIEWRPSFKRGVAPGKAAVMQICGDNSCCHVLHLFHSGIPKNLQSLLEDDTSFKVGMGIAMDAKKVLKDYDVSISTLRDLSDIANQKLG...

XP_057766224.1
MQNAQKMAIHRSLLFRYDFKGPAQLRKFSRMGEMPNSDSDWYHPLTDEDLRAIDSVISSALPPKRHRHDNASAHSPPKLRRRLPSSLFVFQQQQQQQRGFNISTVPFSSCSSRYHGTNRSPVSPFQEIKFGGHIIYSRTMKEVERSAQELLDFVEAKKRNGGQCFLGLDIEWRPSFKRGVAPGKAAVMQICGDNSCCHVLHLFHSGIPKNLQSLLEDDTSFKVGMGIAMDAKKVLKDYDVSISTLRDLSDIANQKLGGDR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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