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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002116`

染色体: Chr05 坐标: 22222536-22224722 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002116`
名称	SmilChr05G002116
描述	UDP-glucuronate 4-epimerase 6
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22222536 - 22224722 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986740`
GeneID	`130986740`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986740`
原始查询	`SmilChr05G002116`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UDP-glucuronate 4-epimerase 6
产物	UDP-glucuronate 4-epimerase 6
Arabidopsis	`AT3G23820` (GAE6) UDP-D-glucuronate 4-epimerase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821965] identity=76.9; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0526100` (OsUGlcAE2) - identity=66; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01073 (3Beta_HSD); PF01370 (Epimerase); PF02719 (Polysacc_synt_2); PF04321 (RmlD_sub_bind); PF16363 (GDP_Man_Dehyd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986740

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057766227.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057766227.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766227.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766227.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766227.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22222875`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C65
`Chr5:22222875`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C65
`Chr5:22222979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr5:22223003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C38
`Chr5:22223150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C73,C77
`Chr5:22223151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr5:22223154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B61,C55
`Chr5:22223168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr5:22223187`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C53
`Chr5:22223187`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C53
`Chr5:22223191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr5:22223210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B98,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766227.1

460 aa

230

460

RmlD_sub_bind

Polysacc_synt_2

Epimerase

3Beta_HSD

GDP_Man_Dehyd

PF04321 RmlD_sub_bind 115-297 aa PF02719 Polysacc_synt_2 115-340 aa PF01370 Epimerase 115-352 aa PF01073 3Beta_HSD 116-396 aa PF16363 GDP_Man_Dehyd 116-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766227.1`	Pfam	`PF04321`	RmlD_sub_bind	Domain	115	297	3.3e-11	43.5	RmlD substrate binding domain
`XP_057766227.1`	Pfam	`PF02719`	Polysacc_synt_2	Family	115	340	5.8e-09	36.3	Polysaccharide biosynthesis protein
`XP_057766227.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	115	352	7.7e-49	167.0	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057766227.1`	Pfam	`PF01073`	3Beta_HSD	Family	116	396	1e-11	45.1	3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family
`XP_057766227.1`	Pfam	`PF16363`	GDP_Man_Dehyd	Domain	116	434	2.9e-44	152.6	GDP-mannose 4,6 dehydratase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910244.1
CGAAATATGAGACTTTTAGAAGAAAAGTGTGGCTCTCATAAGTCATAAGTAACAAATCTCAATCGAACACAGCCCATTTCACAAACAAATAAATTACATAGTACTTTATATAAACGATTTCAACATTATTATAAAATTTGTAATTCCCCCACACCCCCGACCCCACCCCTTCGATCTCATCTCTTCCTCCAAAAACTTCTTTATAATCCAACCCTTCACACCCTTCCCAACTCAGGGTTCACTAAAAACGGATCCACTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986740
ATGCAATATCACACAATGACAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGACACGAGCAAGACGACGAAGCTGGAGCGATACAACAGCTACATCCGGCGCGTGAACAGCACGAAGCTGCTCCAAGCCTCTTCGAAGCTCCTCTTCCGCGTGACCCTTTTGGTTGCCCTCCTCCTCATCTTCTTCTTCACCCTCAACTACCCTCCCCTCTCCCCCTCCTCCTCCTCCGACCACCACCACCACCACCTCCATTCCGCCAACAGCCTCCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766227.1
MQYHTMTGGGGGGDTSKTTKLERYNSYIRRVNSTKLLQASSKLLFRVTLLVALLLIFFFTLNYPPLSPSSSSDHHHHHLHSANSLLSSAFYGSGAAWEKQVRRSSTPRRPNGFSVLVTGAAGFVGSHCSLALKKRGDGVLGLDNFNPYYDPSLKRARQQLLASHGVYIVDGDINDADLLHKLFDMVPFSHILHLAAQAGVRYAMQNPLSYVNSNIAGFVTLLEVAKAADPQPAIVWASSSSVYGLNTQVPFSESDRTDRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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