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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002121`

染色体: Chr05 坐标: 22284437-22285204 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002121`
名称	SmilChr05G002121
描述	uncharacterized SmilChr05G002121
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22284437 - 22285204 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986744`
GeneID	`130986744`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986744`
原始查询	`SmilChr05G002121`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0256300` - identity=41.7; qcov=0.395; evalue=3.6e-11; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986744

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057766234.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057766234.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766234.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766234.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22284500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr5:22284517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B125,B77,C19,C58
`Chr5:22284544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,C2,C44,C8
`Chr5:22284555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr5:22284560`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A10,A18,A20,A21,A25,A3,A6,B103,B107,B111,B117,B120,B130,B135,B138,B139,B2,B25,B3,B35,B37,B50,B56,B58,B62,B66,B71,B73,B86,B88,B95,B96,B99,C18,C23,C29,C31,C34,C45,C60,C72,C9,D5
`Chr5:22284562`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A16,A22,A3,A7,B11,B113,B118,B132,B19,B27,B41,B59,C25,C86
`Chr5:22284581`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B13,B23,B78,C64,C66
`Chr5:22284581`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B13,B23,B78,C64,C66
`Chr5:22284613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B78,C23,D4
`Chr5:22284613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C23,D4
`Chr5:22284685`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A16,A23,B100,B104,B131,B44,B87,C85,D6
`Chr5:22284719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766234.1

152 aa

152

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 26-72 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766234.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	26	72	6.1e-09	36.6	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910251.1
TAATTCGAGACGGGCCCACACCAACGAAATGCAACGGTAATCTAATTACAATTTAGGGTTCAAATAGCAAGAACCCTAATTTTCGAATACTTCTTCCAGAAATTGAGAGAAAAGAACGGAATCTTGTGGAATTAGGCTAGGGTTTTTTCACGTTATCACTATTCGAAGAGAAGCATGAGTTCGAACTCAGGTTTATGGTCATCTTCGCCGCGCGGTAGCCGACAGATGGAGAACGAGTATGATGTCAAGTATTGTAACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986744
ATGAGTTCGAACTCAGGTTTATGGTCATCTTCGCCGCGCGGTAGCCGACAGATGGAGAACGAGTATGATGTCAAGTATTGTAACTGCGGATTTGGAAGCAAGAGGTTGAAAGCTACAAGGATGACTTCGTGGACGGAAGAGAATCCGGGGAGAAGGTTCTATGGATGCAGAAATTGGAAGACCAAAAATTGCGGTTTTTTTGATTGGTATGATGAACCAATGTCTGAGAGAGCGATGGAAGTAATTAACCATTTAAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766234.1
MSSNSGLWSSSPRGSRQMENEYDVKYCNCGFGSKRLKATRMTSWTEENPGRRFYGCRNWKTKNCGFFDWYDEPMSERAMEVINHLKKENMKLVKMNENSTPPTDFEAEIGDLWTEIQACKEESRVDRRKNRFLVIVLIISWFVMMKLLIAGM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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