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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002141`

染色体: Chr05 坐标: 22566157-22569364 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002141`
名称	SmilChr05G002141
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22566157 - 22569364 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986760`
GeneID	`130986760`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986760`
原始查询	`SmilChr05G002141`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0481 protein At3g47200-like
产物	UPF0481 protein At3g47200-like
Arabidopsis	`AT4G31980` (AT4G31980) PPPDE thiol peptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829328] identity=39.5; qcov=0.973; evalue=1.72e-80; confidence=medium
Rice	`Os04g0505400` - identity=32.2; qcov=0.993; evalue=1.27e-55; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986760

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766255.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057766256.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057766255.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766255.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766255.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22567258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr5:22567339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B62,B81
`Chr5:22567353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B62,B79,B81
`Chr5:22567360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B62,B79,B81
`Chr5:22567381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B62,B79,B81
`Chr5:22567384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B79
`Chr5:22567398`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A21,B105,B114,B139,B79,C52
`Chr5:22567414`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A4,B104,B114,B136,B137,B139,B45,B51,B62,B79,B81,C11,C39,C5,C52,C67,C78,C83
`Chr5:22567417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr5:22567418`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A4,B104,B114,B118,B136,B137,B139,B45,B51,B62,B79,B81,C11,C39,C5,C52,C67,C78,C83
`Chr5:22567421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C24,C67
`Chr5:22567427`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A4,B62,C11,C39,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766255.1

471 aa

236

471

DUF247

PF03140 DUF247 69-459 aa

XP_057766256.1

450 aa

225

450

DUF247

PF03140 DUF247 48-438 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766255.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	69	459	7.7e-105	352.2	Plant protein of unknown function
`XP_057766256.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	48	438	6.7e-105	352.4	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910273.1
GGTCCTACAAGTTTATGGTGTGGGTCCCACGAGACAAGGTGTTTGTTTTACTAAAATGAGAAAAAAGCAAACCAAAGAAGATGTAACGGCACAAAACGTGCGGTTGCCAGTGTTGGATCGTTTTGAGCAAAGGCCGAAGAAAACTACAGGTGCCATAAGCAGCAGATGAAAGCTGAGGTTGTGGTGAAGGTTGTGCCATTAGAGATGGAAGAATCAGAAGCTCAAGTGATTGAAAGCTTAACAACTTCCATTGATATAAA...

XM_057910272.1
CTTTCCATATTATCTGCTTTCCTTAGCTCTATGATTTTTGCCCTTTCTCAGCGCAATAAATAACAAGCAGTTGATCTAGATAAACAAGATTTTGTATTTTTTCCTGATTTTGAGTTCCTTGCATTTATCATTTTCTGGGCTCGTTTTCTTATTGCTGTTTGGATTGTCGGTGGAAAACCGACTGCACAGTTAACAAAGTTGTTAGATCAGTTGCGATTTGCTTAATGTTTGAGTCTAATTTGAGATTGAACCATCTTCCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986760
ATGTTTGAGTCTAATTTGAGATTGAACCATCTTCCAGAAGAATTGAGGTGCCATAAGCAGCAGATGAAAGCTGAGGTTGTGGTGAAGGTTGTGCCATTAGAGATGGAAGAATCAGAAGCTCAAGTGATTGAAAGCTTAACAACTTCCATTGATATAAAGTTAAATAAGTTATCTATAGATCCTCCTTACTCGTATACAGCGTGCATCTATACGGTTTCTCAGAAGCTCCGAAAAAATAATGAAGCATCCTATACTCCTCG...

LOC130986760
ATGAAAGCTGAGGTTGTGGTGAAGGTTGTGCCATTAGAGATGGAAGAATCAGAAGCTCAAGTGATTGAAAGCTTAACAACTTCCATTGATATAAAGTTAAATAAGTTATCTATAGATCCTCCTTACTCGTATACAGCGTGCATCTATACGGTTTCTCAGAAGCTCCGAAAAAATAATGAAGCATCCTATACTCCTCGACTAGTGTCAATTGGTCCACTCCATCATGGTAAAGCTCCACTCCAAGGAATGCAAGCGTACAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766255.1
MFESNLRLNHLPEELRCHKQQMKAEVVVKVVPLEMEESEAQVIESLTTSIDIKLNKLSIDPPYSYTACIYTVSQKLRKNNEASYTPRLVSIGPLHHGKAPLQGMQAYKLRFLHNFLSRFSVGLQLQTLVTFAAKEESFVRGCYEGTVNLSTKRLTEMILLDGIFIVELFLESLFFQLRDKNEIIFENHWMYHDLLHDMLLLENQLPISVMNSLLNFVDFTYLNEGMRLSIYDLAQNFFKNVGITHKVQLSEPCSHARHFV...

XP_057766256.1
MKAEVVVKVVPLEMEESEAQVIESLTTSIDIKLNKLSIDPPYSYTACIYTVSQKLRKNNEASYTPRLVSIGPLHHGKAPLQGMQAYKLRFLHNFLSRFSVGLQLQTLVTFAAKEESFVRGCYEGTVNLSTKRLTEMILLDGIFIVELFLESLFFQLRDKNEIIFENHWMYHDLLHDMLLLENQLPISVMNSLLNFVDFTYLNEGMRLSIYDLAQNFFKNVGITHKVQLSEPCSHARHFVEFLLFLHAPENLRKQPIFPAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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