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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002145`

染色体: Chr05 坐标: 22620611-22630207 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002145`
名称	SmilChr05G002145
描述	uncharacterized SmilChr05G002145
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22620611 - 22630207 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986763`
GeneID	`130986763`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986763`
原始查询	`SmilChr05G002145`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	reverse transcriptase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821974]; symbol=AT3G23910; hit=AT3G23910; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	reverse transcriptase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821974]; symbol=AT3G23910; hit=AT3G23910; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G23910` (AT3G23910) reverse transcriptase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821974] identity=39.1; qcov=0.998; evalue=2.22e-87; confidence=medium
Rice	`Os04g0379800` - identity=34.5; qcov=0.853; evalue=4.1e-54; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986763

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766262.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057766263.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057766262.1`
4	Spindle pole body	Spindle pole body	0.20000	`XP_057766263.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766262.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22620915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B61,B8
`Chr5:22621976`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	156	A10,A11,A14,A15,A16,A18,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B106,B109,B11,B110,B111,B112,B114,B118,B12,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B131,B133,B134,B135,B138,B139,B14,B140,B17,B19,B2,B20,B22,B27,B28,B29,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B4,B40,B48,B50,B51,B54,B56,B57,B62,B64,B65,B66,B67,B68,B70,B71,B74,B75,B76,B77,B78,B81,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B96,B97,B98,B99,C1,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C41,C42,C47,C48,C49,C5,C51,C53,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C71,C72,C74,C75,C77,C79,C8,C80,C81,C83,C86,C87,C9,D11,D2,D3,D4,D7,D8,D9
`Chr5:22622014`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	25	B104,B107,B110,B113,B122,B124,B128,B132,B138,B21,B26,B43,B49,B61,B8,C16,C28,C43,C44,C49,C55,C64,C66,D11,D5
`Chr5:22622052`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr5:22622052`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr5:22625904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C82
`Chr5:22626403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B25,B30,C36,C75
`Chr5:22629617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:22629670`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910280.1
GAGATTGGGAAAGGAGAGCGGATCACTCGTCCACTCGGTGTAGTTAACCGAATCGGGATTTCATCCCTCCTCACGATAGATAGCATTAGGGGCGGGGGGGTCTAAAACGTAAAAGTCTCTATTTTCTTTTCGTAAGCGCGAGAGAGCGCATCCCGTGAAATTCAAATTGAAAATACACGAGACCTAGCCACACCACCACCTCTCCTCCGCTGCACCACCACTTCTCCTCCGTCGGCCCGCCACTCAGTCAGCAGCTGGCA...

XM_057910279.1
TAGCATTAGGGGCGGGGGGGTCTAAAACGTAAAAGTCTCTATTTTCTTTTCGTAAGCGCGAGAGAGCGCATCCCGTGAAATTCAAATTGAAAATACACGAGACCTAGCCACACCACCACCTCTCCTCCGCTGCACCACCACTTCTCCTCCGTCGGCCCGCCACTCAGTCAGCAGCTGGCAGCTTCAGCCCGCCAACCTGCAGCTCCAGCCCGACACCGCCGTGCCGCGGCCTTCTGCCCAACTGATTTTTTTTTTCGGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986763
ATGAGCGAACCAAGTATTACTCTTTCTCCACAACCAATTGATCTAAACTTTCTCCAAAGTCGTATTGCGGAGCTCAGAAATGTCGATGAAAAATTTGAACTTGGAGTTGGGGAGGTTGAGAAGTTGACGAATGACGTAGGTTCTGAGCTTGAGAGAAAAATTGATTGGATTTCGTCAGAGTGGTTTTCGAATTTAAGCTCACTGACAACTGAAGACCTAAATGAAACACTGGGGCAATTGAAGAAGGAGCTCAGTGAAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766262.1
MSEPSITLSPQPIDLNFLQSRIAELRNVDEKFELGVGEVEKLTNDVGSELERKIDWISSEWFSNLSSLTTEDLNETLGQLKKELSEVEGENVAIEREVEELQRRCVEDYDKLDTELEKFCCSLEFIESQNEGANENAQIDLSSLADDCANPSNEHGSNFKILELSHQIEKNKTTLKSLQDLDSIYKRFEAVEKIGEAFTGVKVIEIEGNNIRLSLKTYIPYLETVLHRQDIESIVEPLELNHELTIEIVDDTWELKNAEI...

XP_057766263.1
MSEPSITLSPQPIDLNFLQSRIAELRNVDEKFELGVGEVEKLTNDVGSELERKIDWISSEWFSNLSSLTTEDLNETLGQLKKELSEVEGENVAIEREVEELQRRCVEDYDKLDTELEKFCCSLEFIESQNEGANENAQIDLSSLADDCANPSNEHGSNFKILELSHQIEKNKTTLKSLQDLDSIYKRFEAVEKIGEAFTGVKVIEIEGNNIRLSLKTYIPYLETVLHRQDIESIVEPLELNHELTIEIVDDTWELKNAEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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