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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002152`

染色体: Chr05 坐标: 22742117-22744510 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002152`
名称	SmilChr05G002152
描述	vinorine synthase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22742117 - 22744510 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986784`
GeneID	`130986784`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986784`
原始查询	`SmilChr05G002152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vinorine synthase-like
产物	vinorine synthase-like
Arabidopsis	`AT3G26040` (AT3G26040) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822201] identity=34.6; qcov=1.02; evalue=2.34e-62; confidence=low
Rice	`Os02g0611800` (OsHCT2) - identity=25; qcov=1.06; evalue=3.44e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986784

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766295.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057766295.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766295.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766295.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766295.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22743115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B51,C10,D9
`Chr5:22743117`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A22,A7,B16,B30,B36,B45,B59,B66,B72,B76,B79,B85,B86,B90,B92,C21,C70,C82,C83,C84
`Chr5:22743483`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr5:22743483`	`A`	`AAC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr5:22743490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:22743504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:22743514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,D10
`Chr5:22743663`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A18,B124,B132,B21,B50,C16,C43
`Chr5:22743674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B66
`Chr5:22743999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D6
`Chr5:22744029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B26,B61,B8
`Chr5:22744068`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A21,C35,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766295.1

385 aa

192

385

Transferase

PF02458 Transferase 5-384 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766295.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	5	384	2.2e-67	228.3	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910312.1
TAAGTTCCTCCACCCCAACTTATTTTTTTATAATCTCATATGCAACAATTTTTTTGCAAATATTTTTTCAACTATAATTTATTATTTTCATCATATATCATTTAAGTTCATTTTTCTTCGATTTTCTCTCTCTAAAAAAAATTCTCTCTCTCTAGCAAAAAAATTCTCTCTCTAGCTTATAAACTCAATTATCCAAACACTTTGACAACTTATAAACTTTTAAAAATGACATCTTATAAGCTCTTGAAAGAGCTTATAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986784
ATGGAAGGGTTTGTGGAAGTGATATCAAGGGAGATGATAAAGCCCTCATCTCAAACTCCTCTCCACTCCTCAAAGTTGAAGCTCTCTTACATTGATAGAATGTTTTACGATTTATACGTTCCCCTCATCTTCTTCTACAAAGCTGATGAATCAAGAGGCTTAACCGCCTCTAACCATCTTCAGATATCCAAGAGATTGAAACAGTCCCTCTCGAATATCCTACCTTGGTTTCACCCCTTAGCAGGCCGCCTCAAAAGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766295.1
MEGFVEVISREMIKPSSQTPLHSSKLKLSYIDRMFYDLYVPLIFFYKADESRGLTASNHLQISKRLKQSLSNILPWFHPLAGRLKSSLSVDCNDAGAEFIEARARAHLMDSLYMDDQLKHYFPSECNTFNHAKRPRPLLAVQITFFNCGGLIVAAALSHAVTDLASAMKFMKAWAAAFRGEAELSRHSFGTTAYFPPLSLVPFSRFQRLFLFNKNLVTKRLVFSKEKLDALRQTATFPSHESGIKDPSRVELVSAFIWKH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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