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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002160`

染色体: Chr05 坐标: 22841559-22844081 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002160`
名称	SmilChr05G002160
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22841559 - 22844081 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025671`
GeneID	`131025671`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025671`
原始查询	`SmilChr05G002160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
产物	stemmadenine O-acetyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G24430` (AT1G24430) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839059] identity=29.8; qcov=1.16; evalue=1.22e-49; confidence=low
Rice	`Os02g0611800` (OsHCT2) - identity=24.8; qcov=0.817; evalue=4.61e-18; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025671

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811450.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057811450.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057811450.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811450.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811450.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22841686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B33
`Chr5:22841757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,B99
`Chr5:22841855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:22841861`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C85
`Chr5:22841861`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C85
`Chr5:22841865`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C85
`Chr5:22841865`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C85
`Chr5:22841903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:22841912`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B99
`Chr5:22841912`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B99
`Chr5:22841924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C7
`Chr5:22841982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B100,B121,B77,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811450.1

366 aa

183

366

Transferase

PF02458 Transferase 5-68 aa PF02458 Transferase 71-142 aa PF02458 Transferase 160-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811450.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	5	68	6.9e-44	150.9	Transferase family
`XP_057811450.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	71	142	6.9e-44	150.9	Transferase family
`XP_057811450.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	160	359	6.9e-44	150.9	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955467.1
ATGGAAGGATTTGTGCAAGTGATATCGAGGGAGATGCTGAAACCCTCATCTCAAACTCCTCCCCACCCCTCAAAATTGAAGCTCTCTTACATTGATAGAATGTTTAACGACTTATACATTCCCCTCATCTTCTTCTACAAAGCTGATGAATCAAGAGGTTTAACCACCTCTAACCATTCTCGCGCTCATCTCATGGATTCTCTATACATGGATGATCAGTTGAAGCACTACTTTCCTTCCGAGTATAACACATTCAACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025671
ATGGAAGGATTTGTGCAAGTGATATCGAGGGAGATGCTGAAACCCTCATCTCAAACTCCTCCCCACCCCTCAAAATTGAAGCTCTCTTACATTGATAGAATGTTTAACGACTTATACATTCCCCTCATCTTCTTCTACAAAGCTGATGAATCAAGAGGTTTAACCACCTCTAACCATTCTCGCGCTCATCTCATGGATTCTCTATACATGGATGATCAGTTGAAGCACTACTTTCCTTCCGAGTATAACACATTCAACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811450.1
MEGFVQVISREMLKPSSQTPPHPSKLKLSYIDRMFNDLYIPLIFFYKADESRGLTTSNHSRAHLMDSLYMDDQLKHYFPSEYNTFNHGKQARPLRVVQITFFDCGGLAVAVALSHVVADLSSAMAFLNAWAAAFRGEVEISHRSFSTSAYFPPLRLIPLFVFNKEKLDTLRQAATTPSESAIKDPSRVELVSAFIWKHFTEGKLKKSKTKKMYAALHAVNVRPRTNPPNLLENVFGNCFMLAMAFACIKDLRLHGLIGKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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