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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002161`

染色体: Chr05 坐标: 22845596-22852347 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002161`
名称	SmilChr05G002161
描述	uncharacterized SmilChr05G002161
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22845596 - 22852347 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025672`
GeneID	`131025672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025672`
原始查询	`SmilChr05G002161`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0519200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os04g0519200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0519200` - identity=34.7; qcov=0.139; evalue=1.64e-12; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811451.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811451.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811451.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811451.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811451.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22845776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr5:22845782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr5:22845798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr5:22845800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr5:22845813`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A5,C63
`Chr5:22845813`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A5,C63
`Chr5:22845819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A24,A5,B101,B136,B137,B70,B94,C22,C42
`Chr5:22845822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr5:22845823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C8,C80,D10
`Chr5:22845826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr5:22845832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr5:22845844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,B65,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811451.1

684 aa

342

684

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 484-611 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811451.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	484	611	1.5e-10	42.0	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955468.1
ATGACGAGAAAGAAATTTGCCACTGACTCTCCGACTTCACCGGATCCGGTTGTCTCACTGAGCGGCGTGCTGCTACAGCATTCTCCCACAATCGATTCTCCATTGTTTGGCCGGAAATTGAGCAGCGAGTGGCCTCTCCTTCTGAGCGAGGGCTTTCCCTTTCACCCCATCGACTCCATCGCCTCTCCGGCGTCACCGGAGCCCGAATCCTCTGTGAGGGGCGAGCCTCGGCGGAGATTGATGTTCGATCCGCCCGAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025672
ATGACGAGAAAGAAATTTGCCACTGACTCTCCGACTTCACCGGATCCGGTTGTCTCACTGAGCGGCGTGCTGCTACAGCATTCTCCCACAATCGATTCTCCATTGTTTGGCCGGAAATTGAGCAGCGAGTGGCCTCTCCTTCTGAGCGAGGGCTTTCCCTTTCACCCCATCGACTCCATCGCCTCTCCGGCGTCACCGGAGCCCGAATCCTCTGTGAGGGGCGAGCCTCGGCGGAGATTGATGTTCGATCCGCCCGAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811451.1
MTRKKFATDSPTSPDPVVSLSGVLLQHSPTIDSPLFGRKLSSEWPLLLSEGFPFHPIDSIASPASPEPESSVRGEPRRRLMFDPPESSVVQGWVPEYGTALDDDVDTAGWTQVPETEVQPSPMIEVQPPPMTEVSRPFNDDLNPYVKSLAAGPLNEIETYSGYFVNDYRFHITDRDRDSATVNSGVCIKGSVYDRDVLDFYGRLQEVYVLEYPGYLIKKIVLFKCEWFDLSAQGTSIDTDFKLPLLLHPLGGIVDIADDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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