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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002164`

染色体: Chr05 坐标: 22901211-22902727 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002164`
名称	SmilChr05G002164
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	22901211 - 22902727 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986780`
GeneID	`130986780`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986780`
原始查询	`SmilChr05G002164`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stemmadenine O-acetyltransferase-like
产物	stemmadenine O-acetyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G24430` (AT1G24430) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839059] identity=33.3; qcov=1.02; evalue=1.14e-69; confidence=low
Rice	`Os02g0611800` (OsHCT2) - identity=25.7; qcov=1.01; evalue=1.62e-32; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986780

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766289.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057766289.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766289.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766289.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766289.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:22901482`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	98	A11,A14,A16,A18,A23,A9,B1,B102,B107,B110,B111,B112,B115,B12,B121,B123,B13,B133,B134,B135,B138,B15,B20,B22,B27,B28,B29,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B4,B48,B49,B50,B54,B56,B61,B62,B65,B67,B68,B85,B86,B88,B89,B91,B96,B98,B99,C1,C16,C17,C18,C2,C20,C23,C25,C26,C27,C29,C32,C34,C36,C37,C38,C39,C42,C43,C44,C48,C49,C5,C53,C55,C56,C57,C58,C6,C61,C64,C65,C66,C68,C72,C77,C79,C8,C80,C86,C87,C9,D2,D3,D7,D8
`Chr5:22901508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:22901593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:22901600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:22901640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A13,B1,B117,B132,B137,B21,B47,B48,B53,B80,C47,C51,C66,C76
`Chr5:22901647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B122
`Chr5:22901649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D4
`Chr5:22901679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:22901684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B122
`Chr5:22901737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C3,C32,C68
`Chr5:22901751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr5:22901771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B84,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766289.1

427 aa

214

427

Transferase

PF02458 Transferase 5-420 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766289.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	5	420	2e-69	235.0	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910306.1
TGAAATAAGATATGATCAGTTCCACCTATAAAGCTCCCAATTACCATTCGAAGCAATACAAGCCTTATACAGCTCAACATTAGTTGATAGCTAGAATATTCTTTTTTCTTTTTTGTGTGCAAAATGGAAGGATTTGTGCAAGTGATATCGAGGGAGATGCTGAAACCCTCATCTCAAACTCCTCCCCACCCCTCAAAATTGAAGCTCTCTTACATTGATAGAATGTTTAACGACTTATACATTCCCCTCATCTTCTTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986780
ATGGAAGGATTTGTGCAAGTGATATCGAGGGAGATGCTGAAACCCTCATCTCAAACTCCTCCCCACCCCTCAAAATTGAAGCTCTCTTACATTGATAGAATGTTTAACGACTTATACATTCCCCTCATCTTCTTCTACAAAGCTGATGAATCAAGAGGCTTAACCACCTCTAACCATCTCCAAATATCGCAGAGATTGAAACAGTCCATCTCAAATATCCTACCTTCGTTTCACCCCTTAGCAGGCCGCCTCAAAAGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766289.1
MEGFVQVISREMLKPSSQTPPHPSKLKLSYIDRMFNDLYIPLIFFYKADESRGLTTSNHLQISQRLKQSISNILPSFHPLAGRLKSSLSVDCNDAGAEFIEARARAHLMDSLYMDDQLKHYFPSEYNTFNHGKQARPLLVVQITFFDCGGLAVAVALSHVVADLSSAMAFLNAWAAAFRGEVEISHRSFGTSAYFPPLRLIPFSRFQRLFVSNENLMTKRFVFNKEKLDTLRQAATTPSESAIKDPSRVELVSAFIWKHF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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