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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002196`

染色体: Chr05 坐标: 23432419-23433422 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002196`
名称	SmilChr05G002196
描述	uncharacterized SmilChr05G002196
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	23432419 - 23433422 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986799`
GeneID	`130986799`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986799`
原始查询	`SmilChr05G002196`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986799

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057766324.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057766324.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057766324.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057766324.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766324.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:23432844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr5:23432880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C46
`Chr5:23432890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B111,C74
`Chr5:23432890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C74
`Chr5:23432920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:23432932`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A20,B90
`Chr5:23432932`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A20,B90
`Chr5:23432942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,D10
`Chr5:23432956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B51,B84,C29
`Chr5:23432962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B14,B19,B4,B47,C22,C6,C69,C73,C9
`Chr5:23433076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C31,C66
`Chr5:23433077`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B10,B127,B78,B8,C11,C21,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766324.1

155 aa

155

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 21-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766324.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	21	61	1.2e-07	32.4	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910341.1
CCTGTAAATTCCTAACGTTTACTCGAAATTGGTTTTTGCTCCCATTTTCGAAGGTCTTGCGTCTAATTACCTAACCTTTTTTTTGTCTGATTTAGCACCCGTCGTCGATTTTCCCCAAATTTTAAATGATGTGTCACCGGGAAATGATAGCGTGGAGCCGGATTTTGCACAGTTGGAAGCCGAAATGAAAAAAAAGGAACGACGCCATTTCTAATTAAAAGAAACGACGTCGTTTCGCCATCTATTAACACGCAGATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986799
ATGTCGTCTACTTCATCTTCCTCAAATTCGAGCTTCAATCGCGGAGTTTCTCAGGAGGTTGTTTGTGTTCATGAAATTGCAGCTACAATGAACACCTCCCACACTGAAAAGAATCCTGAGATGCGATTCTATTGTTGTAGTCGAACAAAGGCTGAAAATTGTGGATTTTGGAGATGGAAGGATCCAGAGCTTAGTTCGTACTATAAGATGTGCATGAACAAGCTAATTCTTCAACGAGACAAAGTGTCCGAGGAGCTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766324.1
MSSTSSSSNSSFNRGVSQEVVCVHEIAATMNTSHTEKNPEMRFYCCSRTKAENCGFWRWKDPELSSYYKMCMNKLILQRDKVSEELKLCKFMGEMQARKYEDLMTLYEVKCADVEEMKIVMKEQELEISNLKWKLRITKLLLVLIFGVLAMNHFL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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