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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002200`

染色体: Chr05 坐标: 23455196-23457532 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002200`
名称	SmilChr05G002200
描述	cell division control protein 2 homolog C
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	23455196 - 23457532 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986789`
GeneID	`130986789`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986789`
原始查询	`SmilChr05G002200`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cell division control protein 2 homolog C
产物	cell division control protein 2 homolog C
Arabidopsis	`AT2G38620` (CDKB1;2) cyclin-dependent kinase B1;2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818444] identity=81.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0897000` (CDKB) - identity=83.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000082 (G1/S transition of mitotic cell cycle); GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0004693 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction); GO:0010389 (regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle); GO:0010468 (regulation of gene expression); GO:0030332 (cyclin binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF06293 (Kdo); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986789

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766305.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766305.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057766305.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057766305.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766305.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:23455649`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	100	A1,A10,A13,A19,A21,A3,A6,A7,B108,B11,B112,B118,B119,B12,B122,B124,B125,B128,B13,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B14,B16,B2,B23,B27,B29,B3,B30,B31,B34,B36,B37,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B5,B51,B52,B53,B61,B64,B66,B69,B7,B75,B79,B83,B9,B91,B95,C13,C15,C16,C17,C2,C22,C23,C26,C28,C30,C31,C39,C40,C43,C45,C54,C55,C56,C57,C61,C62,C66,C68,C69,C70,C74,C78,C79,C8,C81,C83,C85,C86,C87,C9,D10,D2,D5,D6
`Chr5:23455684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	116	A1,A10,A11,A13,A19,A20,A21,A25,A3,A6,A7,B103,B108,B11,B111,B112,B118,B119,B12,B122,B124,B125,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B14,B16,B18,B2,B23,B27,B29,B3,B30,B31,B34,B36,B37,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B47,B5,B51,B52,B53,B6,B61,B64,B66,B69,B7,B75,B78,B79,B83,B9,B91,B93,B95,C13,C15,C17,C2,C22,C23,C26,C28,C30,C31,C32,C37,C38,C39,C40,C43,C45,C46,C54,C55,C56,C57,C6,C61,C62,C64,C66,C68,C69,C70,C74,C76,C78,C79,C8,C81,C83,C85,C86,C87,C9,D10,D2,D5,D6
`Chr5:23455857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,A7,C50
`Chr5:23456864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B57,B87,B90,B92,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766305.1

304 aa

152

304

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

Kdo

PF00069 Pkinase 4-296 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 7-209 aa PF06293 Kdo 46-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766305.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	4	296	1.5e-66	225.2	Protein kinase domain
`XP_057766305.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	7	209	1.7e-27	97.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057766305.1`	Pfam	`PF06293`	Kdo	Family	46	150	2.7e-05	24.4	Lipopolysaccharide kinase (Kdo/WaaP) family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910322.1
CAACATAGAGTAGTTTATTGATTATTGAAGTATTCGTTAGGAATAGGCGGGCGGGCTCCCAACAATTCAAAATTCAAAGCAACCATTTAAAACAGCACATTTTCAGAGTCTAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATACCTTCCATCAATGGACAAGTACGAGAAGCTCGAGAAGGTCGGTGAGGGAACCTACGGCAAAGTCTACAAAGCCAAGGAGATATCCACCGGCCAGGTGGTGGCGCTCAAGAAAACCCGCCTCGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986789
ATGGACAAGTACGAGAAGCTCGAGAAGGTCGGTGAGGGAACCTACGGCAAAGTCTACAAAGCCAAGGAGATATCCACCGGCCAGGTGGTGGCGCTCAAGAAAACCCGCCTCGAGATGGACGAGGAGGGCGTGCCCCCCACGGCGCTGCGCGAGGTCTCCCTCCTCCAGATGCTCTCTCAGTCGCTCTACGTCGTTCGCCTTCTCCGCGTCGAGCACGTCGACAACAAGAACGGCAAGCCACTCCTCTACCTCGTCTTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766305.1
MDKYEKLEKVGEGTYGKVYKAKEISTGQVVALKKTRLEMDEEGVPPTALREVSLLQMLSQSLYVVRLLRVEHVDNKNGKPLLYLVFEYLDTDLKKYIDSHRKGPNPRPLPQQLIQSFLYQLCKGVAHCHSHGVLHRDLKPQNLLLDKEKGILKIADLGLGRAFTVPLKSYTHEIVTLWYRAPEVLLGSTHYSTAVDMWSVGCIFAEMVRRQALFPGDSEFQQLLHIFRLLGTPTEKEWPGVSSLRDWHVYPQWEPQNFAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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