当前解析结果
SmilChr05G002218| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002218 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002218 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002218 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 23712805 - 23713233 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025679 |
|---|---|
| GeneID | 131025679 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025679 |
| 原始查询 | SmilChr05G002218 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | SOUL heme-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832136]; symbol=HBP5; hit=AT5G20140; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | SOUL heme-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832136]; symbol=HBP5; hit=AT5G20140; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G20140 (HBP5)SOUL heme-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832136] identity=54.2; qcov=0.754; evalue=3.73e-36; confidence=medium |
| Rice | Os06g0597900- identity=58.2; qcov=0.472; evalue=1.63e-17; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF10184 (DUF2358) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025679 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057811456.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.60000 | XP_057811456.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057811456.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811456.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811456.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:23713020 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr5:23713059 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,C82,D11 |
Chr5:23713069 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,D8 |
Chr5:23713070 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C44 |
Chr5:23713088 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B122,B24,C82,D11,D8 |
Chr5:23713104 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,D8 |
Chr5:23713158 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,C82,D11 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057811456.1PF10184
DUF2358 79-141 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057811456.1 |
Pfam | PF10184 |
DUF2358 | Domain | 79 | 141 | 6.2e-10 | 40.0 | Uncharacterized conserved protein (DUF2358) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。