当前解析结果
SmilChr05G002226| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002226 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002226 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002226 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 23789694 - 23794630 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025681 |
|---|---|
| GeneID | 131025681 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025681 |
| 原始查询 | SmilChr05G002226 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025681 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057811458.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057811458.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057811458.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811458.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811458.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:23789702 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B87 |
Chr5:23789820 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | A7,B100,B7 |
Chr5:23789820 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,B100,B7 |
Chr5:23789848 |
C |
CCT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 20 | A19,B112,B117,B124,B131,B18,B26,B34,B40,B5,B55,B6,B64,B97,C18,C19,C24,C46,C72,D5 |
Chr5:23789853 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 29 | A14,A15,B111,B115,B123,B135,B15,B20,B22,B25,B30,B4,B67,B68,B83,B86,C32,C36,C37,C39,C42,C61,C66,C80,C85,C86,D2,D3,D7 |
Chr5:23789875 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr5:23789938 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A20,B133,C15 |
Chr5:23789983 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B107,B138,C28 |
Chr5:23789991 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B44,C74,C82 |
Chr5:23790024 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A13,B48,C4 |
Chr5:23790036 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A13,B48,C4 |
Chr5:23790193 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A14,A20,B107,B133,B138,B44,B65,C14,C15,C23,C28,C74,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。