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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002244`

染色体: Chr05 坐标: 24087176-24091634 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002244`
名称	SmilChr05G002244
描述	protein PHR1-LIKE 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24087176 - 24091634 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024154`
GeneID	`131024154`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024154`
原始查询	`SmilChr05G002244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PHR1-LIKE 2
产物	protein PHR1-LIKE 2
Arabidopsis	`AT3G24120` (AT3G24120) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821998] identity=63; qcov=0.997; evalue=3.24e-122; confidence=high
Rice	`Os09g0299000` (OsPHL3) - identity=59.2; qcov=0.572; evalue=9.22e-69; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF14379 (Myb_CC_LHEQLE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024154

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809638.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809638.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809638.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809638.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24091174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B41
`Chr5:24091264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809638.1

304 aa

152

304

Myb_DNA-binding

Myb_CC_LHEQLE

PF00249 Myb_DNA-binding 43-94 aa PF14379 Myb_CC_LHEQLE 139-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809638.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	43	94	4.4e-08	33.8	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057809638.1`	Pfam	`PF14379`	Myb_CC_LHEQLE	Family	139	185	3.6e-25	88.1	MYB-CC type transfactor, LHEQLE motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953655.1
CTTCCCACGCCTACATGTACTACCTTCGACCCATAGATATATATAAAGACAAATACTGGCCAAAATAACAGACAAAGACAGTACAGAACAAGACATCGCTGTCTTGTTTCCTCCCGACCCCCACCCCTACCCCCACCCCACCACCTTTCCTAACTTCAAAAACAAACCATAACTCCTCCAAAACCACACAAAACTGGATTTTCTTTCCCATCCCGTCTCACCTCGCAGCTCCTTCAATCTTGCTGACATATTTTCTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024154
ATGTATTCGGCTTTGCCAATACACAGTTTGGCAGTGGAGGCGGGAGGGGGGGATTATCCGGGACCGTTGGACGGCACCAACTTGCCTGGAGATGCGTGTCTCGTCCTCTCCACTGATCCTCGCCCGCGCCTGCGCTGGACGGCCGACCTCCATGAGAGATTTGTCGACGCCGTCACGCAGCTCGGCGGCGCTGATAAAGCGACACCAAAAACAATTATGAGAACCATGGGAGTAAAAGGCTTGACTTTGTACCATTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809638.1
MYSALPIHSLAVEAGGGDYPGPLDGTNLPGDACLVLSTDPRPRLRWTADLHERFVDAVTQLGGADKATPKTIMRTMGVKGLTLYHLKSHLQKYRMGKQAGKELTEVSKEVSCIAESQDTGSSTSTSSKMMAQDINDGYQVTEALRVQMEVQQRLHEQLEVQRRLQIRIEAQSKYLQSILDKACKALDDQAVASAGLEAARRELSDLAIKVAHDCNGVLSVPPVSCDASDTTDGHSIPRLPARLGDCSMDSGMMSSNGSPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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