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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002247`

染色体: Chr05 坐标: 24144159-24145849 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002247`
名称	SmilChr05G002247
描述	60S ribosomal protein L13a-4-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24144159 - 24145849 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024156`
GeneID	`131024156`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024156`
原始查询	`SmilChr05G002247`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L13a-4-like
产物	60S ribosomal protein L13a-4-like
Arabidopsis	`AT5G48760` (AT5G48760) Ribosomal protein L13 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834934] identity=89.3; qcov=1; evalue=7.57e-139; confidence=high
Rice	`Os03g0756000` (OSJNBb0081K01.9) - identity=85; qcov=1; evalue=8.05e-133; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0017148 (negative regulation of translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00572 (Ribosomal_L13)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024156

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809640.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809640.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057809640.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057809640.1`
5	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057809640.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24144379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C22
`Chr5:24144433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:24144839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:24144982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C28
`Chr5:24145034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B31,C56,C61,C65
`Chr5:24145487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B133,C15,D10
`Chr5:24145496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B140
`Chr5:24145532`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C23
`Chr5:24145532`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C23
`Chr5:24145534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr5:24145668`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C52
`Chr5:24145668`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809640.1

206 aa

103

206

Ribosomal_L13

PF00572 Ribosomal_L13 11-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809640.1`	Pfam	`PF00572`	Ribosomal_L13	Family	11	115	1.5e-23	83.9	Ribosomal protein L13

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953657.1
AGCCATACAAACTAAACCAAACTACATACAAATACCGCACACCCCATAACCCTAATCTCCCCATCCATCATCCCCCATTTCATCCGCCTCTTCCACAGACAGAGCTCGCAATTCAGAGAGGGAAAAATGGTGTCGGGTTCAGGGATCTGCGCGAAGAGGGTGGTGGTGGACGCCAGGAACCACATGCTCGGCCGCCTCGCCTCCATTTTGGCGAAGGAACTCCTGAACGGGCAGAAGGTCGTCGTCGTCCGCTGCGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024156
ATGGTGTCGGGTTCAGGGATCTGCGCGAAGAGGGTGGTGGTGGACGCCAGGAACCACATGCTCGGCCGCCTCGCCTCCATTTTGGCGAAGGAACTCCTGAACGGGCAGAAGGTCGTCGTCGTCCGCTGCGAGGAAATCTGCCTCTCCGGCGGCCTCGTTCGGCAGAAAATGAAGTACCTGCGCTTCCTCCGCAAGCGTATGAACACCAAGCCCTCTCATGGCCCCATCCACTTCCGCGCTCCTTCGAAGATTCTCTGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809640.1
MVSGSGICAKRVVVDARNHMLGRLASILAKELLNGQKVVVVRCEEICLSGGLVRQKMKYLRFLRKRMNTKPSHGPIHFRAPSKILWRTIRGMIPHKTKRGEAALARLKVYEGVPPPYDKIKRMVIPDALKVLRLQAGHKYCLLGRLSSEVGWNHYDTIRELEKKRKDRAQATYERKKQLIKLRVKAEKIAQEKLGSQLDVIAPIKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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