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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002256`

染色体: Chr05 坐标: 24270647-24276749 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002256`
名称	SmilChr05G002256
描述	uncharacterized SmilChr05G002256
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24270647 - 24276749 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024165`
GeneID	`131024165`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024165`
原始查询	`SmilChr05G002256`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative type 1 membrane protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822002]; symbol=PMP; hit=AT3G24160; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	putative type 1 membrane protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822002]; symbol=PMP; hit=AT3G24160; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G24160` (PMP) putative type 1 membrane protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822002] identity=44.1; qcov=0.976; evalue=2.82e-96; confidence=medium
Rice	`Os08g0567000` - identity=39.8; qcov=0.928; evalue=1.68e-79; confidence=medium
GO	GO:0012505 (endomembrane system)
KEGG	-
Pfam	PF25070 (DUF7794)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024165

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057809649.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.40000	`XP_057809649.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057809649.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057809649.1`
5	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057809649.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24274179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C42
`Chr5:24274419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C38
`Chr5:24274625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C38
`Chr5:24274701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr5:24275418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr5:24275883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C38
`Chr5:24275892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809649.1

374 aa

187

374

DUF7794

PF25070 DUF7794 28-290 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809649.1`	Pfam	`PF25070`	DUF7794	Domain	28	290	8e-111	370.5	Domain of unknown function (DUF7794)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953666.1
CACCCTATTAAGTCGTCCCCTCCCCCCACGGACACCTCTCAGCCCTTTCTTCCTCATAGACGTCAACCACCCTTCACCCTCCTCTCCCCGCTCTGAACACCTCGCCCCACAAACCAATTCTTGCCAACGACTCAGCCTTCCTCCCCTTCCCTCCACCAAAATTCACGTCACCTGTCGACTCTGTCGTCCCTCAACACTGTCTCCCAATCGCACAATCTAATCGTCGTCACTGCCATCGCAAACAAGTAAACTTCAAAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024165
ATGGATCCTCAGAGAGCTTTCTCTCTTTTACTTCTGTTCATCATCTCTCTTCTCTCTCTCCACTCCAAGGTAATTTATGGGGATTCCTCGGTTCTCTTCCTCGATAGTCCTACTCGCCAATATCTTCGACTTTCATTAGATCAGACTGTTTCACTTTCCACATCTGAAATTGGTGCTACTGCATCTGTGTTGCTTGGCTTTGCACCCCCTTCTACCCTCTCTGCCGCTAGCTCATCCAAGCTGAATGAGGTTCTTGCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809649.1
MDPQRAFSLLLLFIISLLSLHSKVIYGDSSVLFLDSPTRQYLRLSLDQTVSLSTSEIGATASVLLGFAPPSTLSAASSSKLNEVLAPNPFDRPRALLMVEVTGAEDSQLVGRSDKSPSGNTLRIKVEGNQRVDIQLPDEAELSMVSLNEASSNAECLDKELSDFASWFGGSYVEDASQSLNGELLIPIANGAFMRLHMSERADREFATSLVMLTSNMKKAMELHQVLTKSEHSPAELMTGRFDGIKALQDRYGKEGIAQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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