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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002259`

染色体: Chr05 坐标: 24326533-24327573 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002259`
名称	SmilChr05G002259
描述	disease resistance protein RPP13-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24326533 - 24327573 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025691`
GeneID	`131025691`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025691`
原始查询	`SmilChr05G002259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPP13-like
产物	disease resistance protein RPP13-like
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=29.5; qcov=0.529; evalue=1.27e-14; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=26.7; qcov=0.919; evalue=9.15e-20; confidence=low
GO	GO:0006952 (defense response); GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025691

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057811465.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811465.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811465.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811465.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811465.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24326771`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	114	A11,A16,A19,A21,A22,A24,A3,A4,A6,A7,B10,B100,B102,B103,B106,B107,B109,B11,B110,B114,B117,B12,B120,B124,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B136,B137,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B21,B26,B29,B30,B34,B36,B4,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B49,B5,B50,B54,B55,B57,B59,B6,B60,B61,B63,B66,B67,B72,B73,B74,B76,B8,B80,B83,B85,B86,B87,B90,B91,B92,B95,C11,C18,C20,C21,C27,C30,C31,C33,C37,C41,C43,C44,C49,C50,C51,C53,C54,C55,C57,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C70,C71,C73,C76,C79,C82,C83,C84,D5,D9
`Chr5:24326816`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:24326816`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:24326854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D1
`Chr5:24326854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:24326954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B121,C4,C42
`Chr5:24327155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C38
`Chr5:24327254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B133,C15
`Chr5:24327264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C4
`Chr5:24327298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C12
`Chr5:24327322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C12
`Chr5:24327374`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B121,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811465.1

346 aa

173

346

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 156-310 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811465.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	156	310	5.7e-21	75.6	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955482.1
ATGGCTTATCCTGCTGTGATTTCTCTCAAGCAAACACTGCACCGCCTTCTCCACTCTTCTCATCACACATTCCTCAACACTCGAAAACTCTTGAAATATGCATACAACCAAACTATATCCCTACAACAACTTCTCAAAAGATTGGACGACTGCCGCACCCAAAATCTGGATGCTGTGGACGAACAAATTAGAGAGGAAACGCACAAACTAGAAGATCTGCTCGAATTCCACGACTCCAATCACTTCCTCCGCCGAGAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025691
ATGGCTTATCCTGCTGTGATTTCTCTCAAGCAAACACTGCACCGCCTTCTCCACTCTTCTCATCACACATTCCTCAACACTCGAAAACTCTTGAAATATGCATACAACCAAACTATATCCCTACAACAACTTCTCAAAAGATTGGACGACTGCCGCACCCAAAATCTGGATGCTGTGGACGAACAAATTAGAGAGGAAACGCACAAACTAGAAGATCTGCTCGAATTCCACGACTCCAATCACTTCCTCCGCCGAGAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811465.1
MAYPAVISLKQTLHRLLHSSHHTFLNTRKLLKYAYNQTISLQQLLKRLDDCRTQNLDAVDEQIREETHKLEDLLEFHDSNHFLRRETNKRKEISASCQNSEEISQGIQSFCKTVDKITKDSVAEIGHFSPEQEHDADLSDAQKGTISVDYDGVMHHLTQRMRPNDFGIFQINGLPGSGATVAAAAVFEDLKHCFDCRARVRVGPRYECKEILLGILAQINEPNELLIGKGEAEIGEFLYASLKGRKYLILMDDVRDVEVW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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