当前解析结果
SmilChr05G002271| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002271 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002271 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002271 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 24418394 - 24418870 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025696 |
|---|---|
| GeneID | 131025696 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025696 |
| 原始查询 | SmilChr05G002271 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025696 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811470.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057811470.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811470.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811470.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811470.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:24418404 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B28,B46,B50,D3 |
Chr5:24418414 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B112,B20,C58 |
Chr5:24418430 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B18,C5 |
Chr5:24418460 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B3,B76,C42,C45,C7 |
Chr5:24418500 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A23,A9,B128 |
Chr5:24418507 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,A2,B40,B9 |
Chr5:24418512 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A6,B74 |
Chr5:24418524 |
GC |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 66 | A11,A16,A24,A4,A5,A6,A8,B104,B108,B117,B12,B121,B127,B129,B13,B130,B132,B138,B16,B17,B22,B24,B31,B36,B38,B47,B49,B52,B60,B64,B79,B8,B82,B83,B85,B9,B94,B97,C1,C11,C12,C21,C26,C28,C3,C30,C34,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C46,C49,C50,C52,C58,C69,C7,C72,C86,C87,D1,D11,D6 |
Chr5:24418534 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A22,B122,C11,C20 |
Chr5:24418560 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr5:24418561 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr5:24418564 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B35,C23,C45 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。