Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002279`

染色体: Chr05 坐标: 24498377-24499826 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002279`
名称	SmilChr05G002279
描述	uncharacterized SmilChr05G002279
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24498377 - 24499826 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024183`
GeneID	`131024183`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024183`
原始查询	`SmilChr05G002279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024183

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809667.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809668.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057809667.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809668.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809668.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24498524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B106,B55,D10
`Chr5:24498571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr5:24499145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B1,B62,D10
`Chr5:24499158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr5:24499177`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A21,A23,B108,B115,B118,B122,B127,B129,B131,B134,B137,B31,B36,B41,B48,B56,B58,B59,B72,B76,B8,B81,C10,C11,C16,C34,C47,C49,C53,C58,C61,C64,C65,C68,C87,D3
`Chr5:24499203`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A5,C49,C54,C74
`Chr5:24499203`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A5,C49,C54,C74
`Chr5:24499218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953685.1
GTAGTCAAAATGTTTGGTGGTTGAAATCCAAGGGGAGGAAGAAGAAAATAGATGATGGTGAAGATGCAGTGAAGGAGAGTGGATATTGCATCAGTTTAAGGTTTATTGGCTGCTGTGTTACTTCAAGATCTACAGTTGATAGCTTTGTGAGTAGCATCAGCACTCATGGGAATAAACCCATCGCCTATGTTTGAGTGTCAAAAAAGGTGGTTAGAATTATTATTGGGTTTACGTGCAGATCCTATCAAGTATTGCACTTG...

XM_057953684.1
CAAGGGGAGGAAGAAGAAAATAGATGATGGTGAAGATGCAGTGAAGGAGAGTGGATATTGCATCAGTTTAAGGTTTATTGGCTGCTGTGTTACTTCAAGATCTACAGTTGATAGCTTTGTGAGTAGCATCAGCACTCATGTTTCATTGGTTGCAGGGAATAAACCCATCGCCTATGTTTGAGTGTCAAAAAAGGTGGTTAGAATTATTATTGGGTTTACGTGCAGATCCTATCAAGTATTGCACTTGCAAAATTCAAGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024183
ATGGGAATAAACCCATCGCCTATGTTTGAGTGTCAAAAAAGGTGGTTAGAATTATTATTGGGTTTACGTGCAGATCCTATCAAGTATTGCACTTGCAAAATTCAAGATTATAAGGCACCTCATTGTGAACAGGATGAGGATGTAAACCTTGATGACGTTGATGCTGAATGTATTCAGCAACAATCAGATATTCATAATAGTATTGTCATGAAGCTGGTTAAGAAAGTTGCCCATAGAGGATCTACAGCTCCAGATAGTAT...

LOC131024183
ATGTTTCATTGGTTGCAGGGAATAAACCCATCGCCTATGTTTGAGTGTCAAAAAAGGTGGTTAGAATTATTATTGGGTTTACGTGCAGATCCTATCAAGTATTGCACTTGCAAAATTCAAGATTATAAGGCACCTCATTGTGAACAGGATGAGGATGTAAACCTTGATGACGTTGATGCTGAATGTATTCAGCAACAATCAGATATTCATAATAGTATTGTCATGAAGCTGGTTAAGAAAGTTGCCCATAGAGGATCTAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809667.1
MFHWLQGINPSPMFECQKRWLELLLGLRADPIKYCTCKIQDYKAPHCEQDEDVNLDDVDAECIQQQSDIHNSIVMKLVKKVAHRGSTAPDSIAKRFDQKSYTYVSM

XP_057809668.1
MGINPSPMFECQKRWLELLLGLRADPIKYCTCKIQDYKAPHCEQDEDVNLDDVDAECIQQQSDIHNSIVMKLVKKVAHRGSTAPDSIAKRFDQKSYTYVSM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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