当前解析结果
SmilChr05G002297| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002297 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002297 |
| 描述 | major allergen Pru ar 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 24791292 - 24792295 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024203 |
|---|---|
| GeneID | 131024203 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024203 |
| 原始查询 | SmilChr05G002297 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | major allergen Pru ar 1-like |
| 产物 | major allergen Pru ar 1-like |
| Arabidopsis | AT1G24020 (MLP423)MLP-like protein 423 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839014] identity=33.1; qcov=0.85; evalue=2.49e-08; confidence=low |
| Rice | Os03g0300400 (JIOsPR10)- identity=38; qcov=0.988; evalue=1.91e-33; confidence=medium |
| GO | GO:0004864 (protein phosphatase inhibitor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006952 (defense response); GO:0009738 (abscisic acid-activated signaling pathway); GO:0010427 (abscisic acid binding); GO:0038023 (signaling receptor activity); GO:0080163 (GO:0080163) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00407 (Bet_v_1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024203 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057809692.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057809692.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809692.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809692.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809692.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:24791560 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
Chr5:24791637 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr5:24792110 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A24 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809692.1PF00407
Bet_v_1 3-155 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809692.1 |
Pfam | PF00407 |
Bet_v_1 | Domain | 3 | 155 | 3.2e-20 | 73.3 | Pathogenesis-related protein Bet v 1 family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。