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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002308`

染色体: Chr05 坐标: 24932172-24933743 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002308`
名称	SmilChr05G002308
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24932172 - 24933743 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024214`
GeneID	`131024214`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024214`
原始查询	`SmilChr05G002308`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
产物	F-box/kelch-repeat protein At3g23880-like
Arabidopsis	`AT3G23880` (AT3G23880) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821971] identity=28.2; qcov=0.951; evalue=8.02e-24; confidence=low
Rice	`Os09g0372900` (OsFbox482) - identity=28; qcov=0.698; evalue=1.28e-21; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF03478 (Beta-prop_KIB1-4); PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024214

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057809706.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809706.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057809706.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809706.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809706.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24932306`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A20,A21,B105,B114,B119,B16,B25,B49,B62,C1,C24,C29,C3,C56,C67
`Chr5:24932310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D11
`Chr5:24932416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr5:24932449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	B20,B30,B36,B38,B39,B59,B66,B72,B76,B90,B92,C21,C58,C70,C76,C83,C84
`Chr5:24932520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C9
`Chr5:24932539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr5:24932555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr5:24932561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A20
`Chr5:24932561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr5:24932768`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B20,B26,B7,C1,C15,C35,C53,C76,C82
`Chr5:24932778`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	B20,B26,B7,C1,C15,C35,C53,C76,C82
`Chr5:24932842`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B104,B20,B7,C15,C33,C35,C41,C53,C76,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809706.1

384 aa

192

384

F-box

F-box-like

FBA_3

Beta-prop_KIB1-4

FBA_1

PF00646 F-box 28-68 aa PF12937 F-box-like 29-65 aa PF08268 FBA_3 94-335 aa PF03478 Beta-prop_KIB1-4 109-310 aa PF07734 FBA_1 128-379 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809706.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	28	68	1.1e-11	44.8	F-box domain
`XP_057809706.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	29	65	2.1e-08	34.5	F-box-like
`XP_057809706.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	94	335	2.7e-18	66.8	F-box associated beta propeller domain
`XP_057809706.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	109	310	1e-08	35.7	KIB1-4 beta-propeller
`XP_057809706.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	128	379	1.7e-23	83.9	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953723.1
GCTGATCTCTTAACTTTCGGCGCGCATGACTGAATTTCCCATATTTGAACACTCTTTTAGTTTTATCTCCACCAAATCCTACATCCAAATTCAAATCCTTGTTCATGTTCATGGCACAATCCCAAACAACCCTCAACACCGAAATCGTGCTATGGATGCCACCATTCCAATTCCTGCTCCTTCCAATTCCCAAGCTCCCAAACGACGTGATCATCGAAATTCTCACCTGGCTCCCAGTAAAATCCCTCTTGAAATTCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024214
ATGTTCATGGCACAATCCCAAACAACCCTCAACACCGAAATCGTGCTATGGATGCCACCATTCCAATTCCTGCTCCTTCCAATTCCCAAGCTCCCAAACGACGTGATCATCGAAATTCTCACCTGGCTCCCAGTAAAATCCCTCTTGAAATTCAAATGCGTCTGCACATCATGGCGAGCCCTAATTTCCAGCCAACGCTTCATCAAAGCCCACCTCGACAACTCTAAATTAGCCCCAAATTCAGCCCACGATATGATCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809706.1
MFMAQSQTTLNTEIVLWMPPFQFLLLPIPKLPNDVIIEILTWLPVKSLLKFKCVCTSWRALISSQRFIKAHLDNSKLAPNSAHDMIAFNCPGNLKQCSVSSMLYESVSQVFDLSLPLYSLKGFKVEGSCNGLLLMTLSKRQTILWNPCTRTYKKLPHFGVEIAEDYYPDYDLGYDKSSDDYKVVGFFDNFTDLSDVIVVVYSLKNDEWKRIKNINGRNVKAGRAAFANGKLYYFTYPDYKYRSDWNILSLDLEKEEEYET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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