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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002316`

染色体: Chr05 坐标: 24985187-24986854 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002316`
名称	SmilChr05G002316
描述	DELLA protein RGL1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	24985187 - 24986854 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025703`
GeneID	`131025703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025703`
原始查询	`SmilChr05G002316`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DELLA protein RGL1-like
产物	DELLA protein RGL1-like
Arabidopsis	`AT1G66350` (RGL1) RGA-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842953] identity=29.2; qcov=0.672; evalue=6.59e-40; confidence=low
Rice	`Os01g0842200` - identity=26.3; qcov=0.706; evalue=2.06e-33; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811477.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811477.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057811477.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811477.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811477.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:24985273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B33,B68,C48
`Chr5:24985377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B46,C39
`Chr5:24985471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B46,C39,D10
`Chr5:24985580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:24985593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:24986584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B21,B46,C39
`Chr5:24986702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,C40,C43
`Chr5:24986731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B89,C10,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811477.1

555 aa

278

555

GRAS

PF03514 GRAS 188-548 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811477.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	188	548	9.8e-72	242.6	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955494.1
ATGTCTAGTTCTAGCAAGGCTTTTGAGAGAGAAAATTATATGCAAGATTCAGTGGAAGACGTTCCTTACCAGTGTGAACTCGACTACTTTCAAGAAGACAAGAGCTTCTGTGAGTCTGATCTGCTCTTTTACGAAGAGCTACAAATCCTGGCTCATTTTGGAGCTCTTGATGATCTGTATCTTGACAAAGCTTCTCCACCATTTCAAGCTTGTAGGGATGGCTTTTTCGCGACGCCTTCCAGCAACAAGGCTCAAGATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025703
ATGTCTAGTTCTAGCAAGGCTTTTGAGAGAGAAAATTATATGCAAGATTCAGTGGAAGACGTTCCTTACCAGTGTGAACTCGACTACTTTCAAGAAGACAAGAGCTTCTGTGAGTCTGATCTGCTCTTTTACGAAGAGCTACAAATCCTGGCTCATTTTGGAGCTCTTGATGATCTGTATCTTGACAAAGCTTCTCCACCATTTCAAGCTTGTAGGGATGGCTTTTTCGCGACGCCTTCCAGCAACAAGGCTCAAGATTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811477.1
MSSSSKAFERENYMQDSVEDVPYQCELDYFQEDKSFCESDLLFYEELQILAHFGALDDLYLDKASPPFQACRDGFFATPSSNKAQDWQPNEEKRPYAFPSAAMEILRHYRSRAGAADGGLERDEGKRQSQRASPPTLLSVSQLIELAVRSFIHSNSENGNDFHLSAVIHQDKTPFSSLSRGESEDIRLVQDLLSCARAVCNHRYACASELLKEFSKLSSGSTNVMQRLVYCFAESLRDKIEIETRGSVNTRPLQLIPPIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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