当前解析结果
SmilChr05G002321| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002321 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002321 |
| 描述 | universal stress protein PHOS32-like |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 25022527 - 25023955 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024224 |
|---|---|
| GeneID | 131024224 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024224 |
| 原始查询 | SmilChr05G002321 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | universal stress protein PHOS32-like |
| 产物 | universal stress protein PHOS32-like |
| Arabidopsis | AT3G17020 (AT3G17020)Adenine nucleotide alpha hydrolases-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820958] identity=62.6; qcov=0.963; evalue=1.37e-76; confidence=high |
| Rice | Os05g0157200- identity=65; qcov=0.975; evalue=4.66e-74; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00582 (Usp) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024224 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057809717.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057809717.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.20000 | XP_057809717.1 |
| 4 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057809717.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809717.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809717.1PF00582
Usp 5-158 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809717.1 |
Pfam | PF00582 |
Usp | Domain | 5 | 158 | 9.9e-28 | 98.2 | Universal stress protein family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。