当前解析结果
SmilChr05G002331| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002331 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002331 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002331 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 25163997 - 25169350 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024234 |
|---|---|
| GeneID | 131024234 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024234 |
| 原始查询 | SmilChr05G002331 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0006397 (mRNA processing) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024234 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809729.1 |
| 2 | Nuclear speckle | 核斑点 | 0.40000 | XP_057809729.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057809729.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057809729.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809729.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:25166028 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B33 |
Chr5:25166488 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr5:25166710 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr5:25166830 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C43 |
Chr5:25166924 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr5:25167214 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B140,B41 |
Chr5:25168367 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。