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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002335`

染色体: Chr05 坐标: 25249731-25289071 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002335`
名称	SmilChr05G002335
描述	uncharacterized SmilChr05G002335
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	25249731 - 25289071 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024236`
GeneID	`131024236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024236`
原始查询	`SmilChr05G002335`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os05g0157300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os05g0157300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G39260` (CCR1) cold, circadian rhythm, and RNA binding 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830082] identity=75.8; qcov=0.063; evalue=2.05e-08; confidence=weak
Rice	`Os05g0157300` - identity=56.1; qcov=0.715; evalue=2.72e-148; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12617 (LdpA_C); PF25160 (LdpA_Fe-S-bd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057809734.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809735.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809735.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809734.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:25249913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr5:25249919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr5:25249937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,C16,C61,C81
`Chr5:25249939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B45,B77,C3,C53
`Chr5:25249939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,B77,C3,C53
`Chr5:25249944`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A14,B78,C40,C50
`Chr5:25249944`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A14,B78,C40,C50
`Chr5:25249948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,C16,C61,C81
`Chr5:25249954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:25249965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B64,D6
`Chr5:25249966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr5:25250017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B99,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809734.1

541 aa

270

541

LdpA_Fe-S-bd

LdpA_C

PF25160 LdpA_Fe-S-bd 269-324 aa PF12617 LdpA_C 334-533 aa

XP_057809735.1

523 aa

262

523

LdpA_Fe-S-bd

LdpA_C

PF25160 LdpA_Fe-S-bd 251-306 aa PF12617 LdpA_C 316-515 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809734.1`	Pfam	`PF25160`	LdpA_Fe-S-bd	Domain	269	324	1.3e-21	76.8	LdpA Fe-S cluster-binding domain
`XP_057809734.1`	Pfam	`PF12617`	LdpA_C	Domain	334	533	1.9e-62	210.8	Light dependent period A C-terminal domain
`XP_057809735.1`	Pfam	`PF25160`	LdpA_Fe-S-bd	Domain	251	306	1.4e-21	76.7	LdpA Fe-S cluster-binding domain
`XP_057809735.1`	Pfam	`PF12617`	LdpA_C	Domain	316	515	1.8e-62	210.9	Light dependent period A C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101699.1
CGTTATTTACTGCTATCTTAATATTGTGTATCATAGCCCCCATTCATCACCACCGATCAATCGCTCGGTCAGGCCTTCTCTCAATTCGGCAAAGTCATCGAATCGAAGATTGTCAACGATCGAGAGACCGGTAGATCGAGAGGATTCGGTTTCGCGACATTCAAGAATGAGCAATCCATGAGGGATGCGATCGAGGGGATGAACGGACAGGAATTGGACTGCCGTAATATCACCGTCAACGAGTCTCAGTCTCGCGGAAG...

XM_057953752.1
TCGTTATTTACTGCTATCTTAATATTGTGTATCATAGCCCCCATTCATCACCACCGATCAATCGCTCGGTCAGGCCTTCTCTCAATTCGGCAAAGTCATCGAATCGAAGATTGTCAACGATCGAGAGACCGGTAGATCGAGAGGATTCGGTTTCGCGACATTCAAGAATGAGCAATCCATGAGGGATGCGATCGAGGGGATGAACGGACAGGAATTGGACTGCCGTAATATCACCGTCAACGAGTCTCAGTCTCGCGGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024236
ATGAGGGATGCGATCGAGGGGATGAACGGACAGGAATTGGACTGCCGTAATATCACCGTCAACGAGTCTCAGTCTCGCGGAAGCAGCGATGGAGGTTTCTGTGGCCCACGCCGCGAGGGTGGCGGGGGCGGTGGTGGTGGTTACGGGCACTGCGAGGGCGGTGGCGGTGGCGGAGGATATGGTCGTTGTGCTATGATTTCGATCGATGTATTTGATAGTGAAGTTGGATTTTCAATTATGACTACAGAAAATCTAGGCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057809734.1
MRDAIEGMNGQELDCRNITVNESQSRGSSDGGFCGPRREGGGGGGGGYGHCEGGGGGGGYGRCAMISIDVFDSEVGFSIMTTENLGDKDLFLNCLASNSMQKIQSYNITASLPLHKSKGALLIKGTSAAFPKINFHDHFRQALSYRGEHHAKSKNVGGIAQVQELITKTGIPSTITSPLASLHMGNWVKLICGASFEDVTDIRNLSLVYTLAGVDCIDCAAEASVINAVNEGIEAARCILPIRRPWVMISVNDGEDLHFR...

XP_057809735.1
MRDAIEGMNGQELDCRNITVNESQSRGSSDGGFCGPRREGGGGGGGGYGHCEGGGGGGGYGRCAMISIDVFDSEVGFSIMTTENLGDKDLFLNCLASNSMQKIQSYNITASLPLHKSKGALLIKGTSAAFPKINFHDHFRQALSYRGEHHAKSKNVGGIAQVQELITKTGIPSTITSPLASLHMGNWVKLICGASFEDVTDIRNLSLVYTLAGGIEAARCILPIRRPWVMISVNDGEDLHFRKAEFNPDDCPLDCLRPCE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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