同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度/序列长度;置信度是规则分级,不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及有 accession 序列支持的文献基因名查询;未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr05G002347

染色体: Chr05 坐标: 25437754-25439142 链方向: - 类型: lncRNA

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr05G002347
名称SmilChr05G002347
描述uncharacterized SmilChr05G002347
染色体 / SeqIDChr05 / NC_080391.1
坐标与链方向25437754 - 25439142 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131024247
GeneID131024247
locus_tag-
NCBI NameLOC131024247
原始查询SmilChr05G002347

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation
描述uncharacterized SmilChr05G002347
产物uncharacterized SmilChr05G002347
Arabidopsis-
-
Rice-
-
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131024247

打开注释模块

非零投票定位候选(最多五项)

特征证据限制:抽查两个保留的历史缓存共 206 行,PROFEAT 特征全部为零;第二块缓存为 106 行,比对应 FASTA 的 100 个蛋白多 6 个。ESM2 特征在抽查范围内为有限非零值。缓存与当前定位结果的历史执行链仍未核实,不能据蛋白编号重合认定这些特征用于线上预测,也不能将抽查推广到全蛋白组。当前结果仅作为探索性候选,特征完整性与预测可靠性尚未建立。

亚细胞定位结果正在生成或该基因暂无预测结果。

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XR_009101705.1
TCTTTTCTTAATTCCCAACTTCTTTTTATAATATAAATATCAAACCCATATTCTAATATACACATGTATAGCACGATACATAGACTAATATAAATGATCTTCAAATATTCAAGGCCTGAGGTCCTTGATTGGTGGTGTGGTATTTAATTTTTTTATTTACTTATATACCTTATCAAAAAAAGAAGATAACACACCTTTGAAAAATTGTGAGAAAAGAATCTTACCATAAGTTGAGTTCTGAATCTTGAAATCATGGCTGC...

CDS

0 records

此非编码 RNA 无 CDS 或蛋白序列。

Protein

0 records

此非编码 RNA 无 CDS 或蛋白序列。

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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