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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002348`

染色体: Chr05 坐标: 25462389-25464809 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002348`
名称	SmilChr05G002348
描述	probable enoyl-CoA hydratase 1, peroxisomal
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	25462389 - 25464809 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024248`
GeneID	`131024248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024248`
原始查询	`SmilChr05G002348`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable enoyl-CoA hydratase 1, peroxisomal
产物	probable enoyl-CoA hydratase 1%2C peroxisomal
Arabidopsis	`AT4G16210` (ECHIA) enoyl-CoA hydratase/isomerase A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827314] identity=71; qcov=0.97; evalue=3.44e-137; confidence=high
Rice	`Os03g0310400` - identity=70.8; qcov=0.925; evalue=1.64e-130; confidence=high
GO	GO:0005777 (peroxisome)
KEGG	smil00071 (Fatty acid degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00280 (Valine, leucine and isoleucine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00310 (Lysine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00360 (Phenylalanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00380 (Tryptophan metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00640 (Propanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00650 (Butanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00378 (ECH_1); PF16113 (ECH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057809750.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809750.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057809750.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809750.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809750.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:25462620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:25462675`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A21,A9,B106,B119,B123,B134,B2,C18,C35,C72,D2
`Chr5:25462822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr5:25462831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:25464008`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C35
`Chr5:25464008`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C35
`Chr5:25464038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:25464069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:25464183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809750.1

267 aa

134

267

ECH_1

ECH_2

PF00378 ECH_1 17-242 aa PF16113 ECH_2 22-211 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809750.1`	Pfam	`PF00378`	ECH_1	Domain	17	242	1.8e-53	182.2	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
`XP_057809750.1`	Pfam	`PF16113`	ECH_2	Domain	22	211	5.4e-25	89.3	Enoyl-CoA hydratase/isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953767.1
ACGATCCCATGTGTGTGCCACCACCATGGGGTGGTGCGACAGTGGATGCTCAAACTCATTGTGTTATCCGTTACATCACCGATAAGGCTATTTTGACACGCATTTCAACAAGTACGCATCCTTATTTTTATATACATATACTAGCAAACACGATGATACACAGATTCAATACACCGCACCAATGGAGATCCCTGCGCCGCCGCCGGAAAAGCTCATTTTCACTCACCGGGAGCCAAACGGCGTCGCATTCGTGCTCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024248
ATGGAGATCCCTGCGCCGCCGCCGGAAAAGCTCATTTTCACTCACCGGGAGCCAAACGGCGTCGCATTCGTGCTCATCAACCGTCCAAAGGCCCTCAACTCCCTCACCCGGCTGATGATCGAGGACTTGGCCGCCGCGATCAAGAGCTTGGCGTCGGACGATTCGGTTCAGGTCATCATCCTATCCGGGTCGGGTCGAGCTTTCTGCTCCGGCGTTGACCTGACAGCGGCGGAGGACGTCTTCAAGGGGAACGTCAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809750.1
MEIPAPPPEKLIFTHREPNGVAFVLINRPKALNSLTRLMIEDLAAAIKSLASDDSVQVIILSGSGRAFCSGVDLTAAEDVFKGNVKDPETDPVVQMELCKKPIIGAINGFAVTAGFEIALACDLLVASKEAKFMDTHARFGIFPSWGLSQKLSRIIGPSRAREVSFTAAPVTAEQAERWGLVNHVVEGNELLRKARQIAEAMIRNNRDLVHMYKAVINDGFKLDLAHGLALEKERGHAYYDGMTKEQFKKMQDFIASRSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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