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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002349`

染色体: Chr05 坐标: 25464829-25468113 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002349`
名称	SmilChr05G002349
描述	stachyose synthase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	25464829 - 25468113 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024249`
GeneID	`131024249`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024249`
原始查询	`SmilChr05G002349`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stachyose synthase-like
产物	stachyose synthase-like
Arabidopsis	`AT4G01970` (STS) stachyose synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828186] identity=55.2; qcov=0.787; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0170000` (RS5) - identity=52.7; qcov=0.522; evalue=8.26e-125; confidence=medium
GO	-
KEGG	smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05691 (Raffinose_syn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024249

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809751.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809751.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809751.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809751.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809751.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:25465103`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B109,C7,C79
`Chr5:25465103`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B109,C7,C79
`Chr5:25465138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,C33,D10,D11
`Chr5:25465176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C33,C78
`Chr5:25465199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B21
`Chr5:25465218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr5:25465275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B136,C33,D10,D11
`Chr5:25465277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C33,C78
`Chr5:25465313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B136,C33,D10,D11
`Chr5:25465333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B132,B21
`Chr5:25465383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B74,B77,C53,D10
`Chr5:25465426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A14,A9,B123,B133,B138,B20,B4,B48,B62,B71,B81,B88,B98,C1,C17,C19,C22,C25,C27,C32,C34,C41,C45,C5,C53,C57,C6,C61,C64,C66,C68,C80,C86,C9,D3,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809751.1

647 aa

324

647

Raffinose_syn

PF05691 Raffinose_syn 27-124 aa PF05691 Raffinose_syn 170-631 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809751.1`	Pfam	`PF05691`	Raffinose_syn	Family	27	124	1.1e-219	731.8	Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1
`XP_057809751.1`	Pfam	`PF05691`	Raffinose_syn	Family	170	631	1.1e-219	731.8	Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953768.1
CGCCCAATTTTTGCCTATAAATAATCCAACAAACCGACCTCTTCTCTTCATCAAGTTCTACAAATATCCTTATATTCCACCAACTCTTTCATCAGTCATTCAAATCTCTTCTCGTGAAATTTTTATTTTCAAGAATCTTTTCTCTTTCGTGAATAGCAATATTCCCAACTCTGTTGAGCCATTTTTTTCCATTGTTCTAAACTTGTAAGTGAATCATGTCACCACCTAACTTCATTCTTGAAAAAATTTCAAGTTATTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024249
ATGTCACCACCTAACTTCATTCTTGAAAAAATTTCAAGTTATTTTCAAAAAGCAAAACCTCAACCATGCAGATTCATGCTTTCTTCAGACAGGGAAATCTCAGTAGATGGAGTCACACTCCTCGCTGAAGTTCCCGAAAACATAACACTTTCGAGTTTCACTTCAGTTTGTAGCTCTCCCAACTCCGACTCTCCTCCTCCCAAACACATCCTGAAATCAGTCGAATCCAACGCAGCAAATGGCGCCTTCATAGGGCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809751.1
MSPPNFILEKISSYFQKAKPQPCRFMLSSDREISVDGVTLLAEVPENITLSSFTSVCSSPNSDSPPPKHILKSVESNAANGAFIGLSVEKPLDRILCSIGKFSNRKFLSIFRFKTWWSTMWTVDQEEHDRVFKEMIELAEKKKALEKAGEDGSGLPEARTIEYLEALEGVEPGGLKALIGDLRREFPSLDEVYVWHALCGAWGGVRPGTTHLNAKVTSAKAGPGLAKTMFDLAVVMIEKGGIGLVDPDEAEEFYDAMHSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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