当前解析结果
SmilChr05G002363| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002363 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002363 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002363 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 25785768 - 25788050 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024260 |
|---|---|
| GeneID | 131024260 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024260 |
| 原始查询 | SmilChr05G002363 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024260 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809764.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057809764.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057809764.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809764.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057809764.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:25786036 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B71,C25,D9 |
Chr5:25786042 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B71,C25,D9 |
Chr5:25786047 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A3,B51 |
Chr5:25786048 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A22 |
Chr5:25786054 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B133,C13,C40 |
Chr5:25786073 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C25,D3,D9 |
Chr5:25786092 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr5:25786093 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B82 |
Chr5:25786093 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B82 |
Chr5:25786141 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 52 | A1,A11,A16,A21,A25,A3,A6,A7,B102,B105,B113,B121,B123,B127,B134,B14,B15,B28,B31,B38,B4,B44,B46,B5,B50,B53,B62,B77,B82,B85,B89,C11,C14,C18,C27,C29,C3,C31,C33,C35,C42,C44,C45,C49,C58,C67,C69,C7,C76,C79,C80,C83 |
Chr5:25786142 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B20,B34 |
Chr5:25786144 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 13 | A14,A2,A5,B123,B140,B19,B28,B34,B69,C1,C5,D6,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。