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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002368`

染色体: Chr05 坐标: 25863007-25865305 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002368`
名称	SmilChr05G002368
描述	dicarboxylate transporter 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	25863007 - 25865305 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024262`
GeneID	`131024262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024262`
原始查询	`SmilChr05G002368`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dicarboxylate transporter 1, chloroplastic-like
产物	dicarboxylate transporter 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G12860` (DiT1) dicarboxylate transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831126] identity=79.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0515400` - identity=83.2; qcov=0.856; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00939 (Na_sulph_symp); PF03600 (CitMHS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809767.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057809767.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809767.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809767.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:25863379`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A6
`Chr5:25863379`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A6
`Chr5:25863382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:25863451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:25863502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A2,B40,B63
`Chr5:25863574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr5:25863793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B79,C33,C78
`Chr5:25864102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:25864129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B91,D3
`Chr5:25864962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809767.1

549 aa

274

549

Na_sulph_symp

CitMHS

PF00939 Na_sulph_symp 85-549 aa PF03600 CitMHS 122-442 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809767.1`	Pfam	`PF00939`	Na_sulph_symp	Family	85	549	4.3e-147	491.6	Sodium:sulfate symporter transmembrane region
`XP_057809767.1`	Pfam	`PF03600`	CitMHS	Family	122	442	6e-24	85.5	Citrate transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953784.1
TTGGTATAATTGGTGTATTTATAGAAAAGTGACGACATTTGGCAGGCGGAGTTTGCAAAATGTAGAAGACGGAGTTTTCCAAGTGAAAAAGCTGCCTCCACTCTGTCAGATTCAAATATTAAATTACCAACTTCTCTCTCTCTCTCACATACGCGCAGCGCAAGCTTGAATTTGAATCTCGGAGATGGCGTCTCTAGCCCTCTCCCCCTCCTTAAACATCCGCCTCCGCCCCCAATCCAACCCCTGCTCCCGCTCCCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024262
ATGGCGTCTCTAGCCCTCTCCCCCTCCTTAAACATCCGCCTCCGCCCCCAATCCAACCCCTGCTCCCGCTCCCCCAAATCTCTTCGCCTTCAATTTAGATCTCCCACCAAAATCACTGCTACTACCCACAATTTCTCGAATCCTCAATTTCAAAATTCGCCCCTCTTGGTTGGGGCCCAGAAACGCCGACCGCTAACAGTCGCCTCTGCTTCAGCGGCCCCTCAGTCACAGGCATGGCAGGGGGCTTCGATGAAGCCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809767.1
MASLALSPSLNIRLRPQSNPCSRSPKSLRLQFRSPTKITATTHNFSNPQFQNSPLLVGAQKRRPLTVASASAAPQSQAWQGASMKPLMASIATGVILWFVPAPDGVSRIAWQLLSIFLATIVGIISQPLPLGAVALMGLGACVLTKTLTFAAAFSAFGDPIPWLIALAFFFARGFIKTGLGNRIAYQFVSLFGSSSLGLGYSLVFSEALLAPAIPSVSARAGGIFLPLVKSLCVACGSNVGDGTENKLGSWLMLTCFQTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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