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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002378`

染色体: Chr05 坐标: 26092113-26093741 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002378`
名称	SmilChr05G002378
描述	transcription factor MYB108
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	26092113 - 26093741 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024270`
GeneID	`131024270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024270`
原始查询	`SmilChr05G002378`

查看完整 ID 对照表

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmMYB9b` P017; 2017	`JX113685`	`LOC131024270` `SmilChr05G002378` GeneID 131024270	protein; identity 98.864%; coverage 100.0%	High-confidence sequence match	DOI
`SmMYB9b` P017; 2017	`JX113686`	`LOC131024270` `SmilChr05G002378` GeneID 131024270	protein; identity 98.864%; coverage 100.0%	High-confidence sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB108
产物	transcription factor MYB108
Arabidopsis	`AT1G48000` (MYB112) myb domain protein 112 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841218] identity=58; qcov=0.912; evalue=6.64e-88; confidence=high
Rice	`Os03g0315400` (OsMYB2) - identity=83.2; qcov=0.594; evalue=2.14e-91; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809772.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809772.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809772.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809772.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:26092483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C60
`Chr5:26092524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B65,B78,C23,D1
`Chr5:26092633`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B25,C7,D9
`Chr5:26092669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B106,B2,C35
`Chr5:26092675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr5:26093407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809772.1

261 aa

130

261

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 23-70 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 26-83 aa PF00249 Myb_DNA-binding 76-119 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 80-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809772.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	23	70	9e-35	119.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057809772.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	26	83	1.6e-20	73.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057809772.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	76	119	9e-35	119.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057809772.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	80	123	1.6e-20	73.7	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953789.1
AACATTTTCAAACCTCTCCTGTTCCATCTATATAAAGCCCCTCCCTCCTTTATCCTCTTCCACATCAACACAACCCCACCCCTTTCTCTCTCTACATCTATACATCACCACCACTTTCTCTCTCCACACCATCATCAACTTTTCTTGTTGAGGGAGGATTCCTAGAGAGCGAAATTAACACGAGATGGATCATCACCAAGATGACACAAAATCATACAGCCAAAGTGAAGAAGATTTGTTGGAGCTGAGGAGAGGGCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024270
ATGGATCATCACCAAGATGACACAAAATCATACAGCCAAAGTGAAGAAGATTTGTTGGAGCTGAGGAGAGGGCCATGGACAGTTGATGAAGATTTTACTCTCATCAACTATATAGCCCACCATGGCGAAGGCCGTTGGAATTCTCTAGCTCGCTCTGCAGGTTTGAAGAGAACCGGCAAGAGCTGCAGATTGAGGTGGCTAAACTACCTGCGGCCCGACGTCCGCCGCGGAAACATCACTCTCGAGGAGCAGCTGCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809772.1
MDHHQDDTKSYSQSEEDLLELRRGPWTVDEDFTLINYIAHHGEGRWNSLARSAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEEQLLILELHSRWGNRWSKIAQHLPGRTDNEIKNYWRTRVQKHAKQLKCDVNSKQFKDTMRYLWMPRLVERIQAAAAAAPNLDVAVALPRPENSSAAASSESFGTPASDLTDCYNNQDCYAANNNQFSYGDQLSLSSPSGYFNQGLDFGGQWAMDGGDASDSLWSVDDVWFLQQQFNTN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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